Catalogue du code natif

200 articles avec le code de leurs auteurs, sur 1 704 lus ; 309 dépôts de code, dont 288 vérifiés vivants.

Lundi 21 septembre 2026 (1 article)

[1] doi:10.7554/elife.106554 [article, code]

Enhanced tactile coding in rat neocortex under darkness.

Revue : eLife

Code des auteurs : ut-yakusaku/yamashiro-elife-2024 (MIT)

Statut : code vérifié, 9 fichiers lisibles

Samedi 19 septembre 2026 (1 article)

[2] doi:10.1096/fba.2026-00194 [article, code]

Glial and Vascular Plasma Biomarkers Across the Alzheimer's Disease Continuum: An ADNI-Based Longitudinal Study.

Revue : FASEB bioAdvances

Code des auteurs : khodakaram/adni-glial-vascular-axis (MIT), khodakaram/adni‐glial‐vascular‐axis (sans licence)

Statut : code vérifié, 17 fichiers lisibles

Vendredi 18 septembre 2026 (9 articles)

[3] doi:10.1007/s00422-026-01061-5 [article, code]

Modeling synaptic interactions between mammalian breathing and swallowing central pattern generators.

Revue : Biological cybernetics

Code des auteurs : ptolmachev/simplifiedmodel_rcpg_swcpg_interaction (MIT)

Statut : code vérifié, 45 fichiers lisibles

[4] doi:10.7554/elife.98369 [article, code]

Linear antibody epitope prediction using AlphaFold2.

Revue : eLife

Code des auteurs : jbderoo/pabfold (sans licence)

Statut : code vérifié, 7 fichiers lisibles

[5] doi:10.7554/elife.100880 [article, code]

An applicable and efficient retrograde monosynaptic circuit mapping tool for larval zebrafish.

Revue : eLife

Code des auteurs : navis-org/navis (AGPL-3.0), soaringdu/proj-rvct (sans licence)

Statut : code vérifié, 305 fichiers lisibles

[6] doi:10.1371/journal.pone.0351534 [article, code]

Recurrent and system-specific model-attribution patterns in PISA 2022 science performance across nine education systems.

Revue : PloS one

Code des auteurs : lemon-creat/pisa-2022-science-prediction (MIT)

Statut : code vérifié, 41 fichiers lisibles

[7] doi:10.1126/sciadv.adx0731 [article, code]

Targeting glial PD-1/PD-L1 restores microglial homeostasis and reduces neuronal hyperactivity in an Alzheimer's disease model.

Revue : Science advances

Code des auteurs : Zenodo 19411437 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

[8] doi:10.1126/sciadv.aef5358 [article, code]

Thalamic modulation of cortical linearity across arousal states.

Revue : Science advances

Code des auteurs : Zenodo 19905547 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 2 fichiers lisibles

[9] doi:10.1093/braincomms/fcag279 [article, code]

Network flexibility facilitates treatment-induced recovery in post-stroke aphasia.

Revue : Brain communications

Code des auteurs : isaacfalconer/dfc_toolbox (MIT), osf:zja2b (sans licence)

Statut : code vérifié, 80 fichiers lisibles

[10] doi:10.1523/eneuro.0283-26.2026 [article, code]

A Cortico-Basal Ganglia-Thalamic Network Model Linking Intermittent Postural Control to Sway-Related Beta-Band Oscillations.

Revue : eNeuro

Code des auteurs : nomura-taishin/cbgt-intermittent-postural-control (Apache-2.0)

Statut : code vérifié, 12 fichiers lisibles

[11] doi:10.1093/nc/niag059 [article, code]

Doing the math: detection and neural processing of auditory task-unrelated stimuli while solving arithmetic tasks.

Revue : Neuroscience of consciousness

Code des auteurs : osf:5fehs (sans licence)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

Jeudi 17 septembre 2026 (6 articles)

[12] doi:10.1007/s00422-026-01063-3 [article, code]

Increased firing rates monotonically expand neuronal coding bandwidth.

Revue : Biological cybernetics

Code des auteurs : bendalab/punitmodel (AGPL-3.0), doi.gin.g-node.org/10.12751/g-node.5b08du (sans licence)

Statut : code vérifié, 11 fichiers lisibles

[13] doi:10.1371/journal.pone.0356243 [article, code]

Functional organization and natural scene responses across mouse visual cortical areas revealed with encoding manifolds.

Revue : PloS one

Code des auteurs : dyballa/neuralencodingmanifolds (BSD-2-Clause)

Statut : code vérifié, 28 fichiers lisibles

[14] doi:10.1371/journal.pone.0357708 [article, code]

Construction and optimization of deep learning intent classification model for smart home dialogue.

Revue : PloS one

Code des auteurs : Zenodo 21998257 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 15 fichiers lisibles

[15] doi:10.1038/s41514-026-00439-w [article, code]

Effects of a three-month exercise programme on cognition, mood and neurogenesis: the NeuroFit randomised controlled trial.

Revue : npj aging

Code des auteurs : thuretlabkcl/neurofit-rct-statistical-code (MIT)

Statut : code vérifié, 5 fichiers lisibles

[16] doi:10.1039/d6sc02874h [article, code]

Training a force field for proteins and small molecules from scratch.

Revue : Chemical science

Code des auteurs : greener-group/garnet (MIT), greener-group/openfe (MIT), juliamolsim/molly.jl (MIT)

Statut : code vérifié, 404 fichiers lisibles

[17] doi:10.1162/imag.a.1362 [article, code]

Human fMRI at 11.7T: Assessing feasibility, stability, and reliability on the Iseult scanner.

Revue : Imaging neuroscience (Cambridge, Mass.)

Code des auteurs : zaineb18/tristan_pipeline (MIT)

Statut : code vérifié, 44 fichiers lisibles

Mercredi 16 septembre 2026 (9 articles)

[18] doi:10.1007/s12021-026-09817-x [article, code]

Circle of Willis-Guided Localization for Simultaneous Detection and Classification of Large Vessel Occlusions in Brain CTA.

Revue : Neuroinformatics

Code des auteurs : mic-dkfz/nndetection (sans licence), nic-vicorob/cow-multiclass-segmentation-topcow24 (sans licence)

Statut : code vérifié, 740 fichiers lisibles

[19] doi:10.1371/journal.pcbi.1014752 [article, code]

Hierarchical feature binding in a spiking neural network model of the primate ventral visual pathway.

Revue : PLoS computational biology

Code des auteurs : bcgardner/feature_binding (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 187 fichiers lisibles

[20] doi:10.1126/sciadv.aeg5281 [article, code]

Human cardiac measurements with diamond magnetometers.

Revue : Science advances

Code des auteurs : Zenodo 20703821 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié

[21] doi:10.1038/s42003-026-10957-8 [article, code]

Brain defence by the extracellular matrix protein Cochlin.

Revue : Communications biology

Code des auteurs : animesh/scripts (LGPL-2.1), raghumoy/cochlin_manuscript (sans licence)

Statut : code vérifié, 1 156 fichiers lisibles

[22] doi:10.1002/advs.77822 [article, code]

Temporal Trajectories of the Tau Aggregate Interactome Reveal Stage-Specific Vulnerabilities in Alzheimer's Disease.

Revue : Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)

Code des auteurs : Zenodo 17990783 (MIT), dboeken/boeken_tau_aggregate_interactome (MIT)

Statut : code vérifié, 19 fichiers lisibles

[23] doi:10.2147/jir.s633117 [article, code]

Single-Nucleus Transcriptomic Mapping Reveals Correlative Microglial Changes Associated with rTMS in the Motor Cortex After Spinal Cord Injury.

Revue : Journal of inflammation research

Code des auteurs : 10xgenomics/cellranger (MIT)

Statut : code vérifié, 789 fichiers lisibles

[24] doi:10.7554/elife.101204 [article, code]

Larger language models better align with neural representations of natural language.

Revue : eLife

Code des auteurs : hassonlab/247-pickling (sans licence), hassonlab/247-encoding (MIT)

Statut : code vérifié, 29 fichiers lisibles

[25] doi:10.1007/s12021-026-09784-3 [article, code]

Estimating Mutual Information and Pearson Correlation on Neural Evoked Responses.

Revue : Neuroinformatics

Code des auteurs : aaltoimaginglanguage/micorr (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 29 fichiers lisibles

[26] doi:10.1038/s41531-026-01531-4 [article, code]

Inconsistent subthalamic local field potential beta activity amid in- and antiphasic neuronal bursts.

Revue : NPJ Parkinson's disease

Code des auteurs : maximilianscherer/2026_ms_beta_prevalence (sans licence), Zenodo 17951551 (CC-BY-4.0), Zenodo 17940236 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 72 fichiers lisibles

Mardi 15 septembre 2026 (1 article)

[27] doi:10.1038/s44271-026-00524-6 [article, code]

Emergent blink rate in early childhood is associated with neural origins of executive function.

Revue : Communications psychology

Code des auteurs : osf:mrz89 (sans licence)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

Vendredi 4 septembre 2026 (6 articles)

[28] doi:10.1126/sciadv.aef0343 [article, code]

Learning induces activation-mechanism-dependent neural plasticity in an intracortical microstimulation task.

Revue : Science advances

Code des auteurs : xieluanlab/icms-activation-plasticity (sans licence), Zenodo 21384216 (sans licence)

Statut : a_scanner

[29] doi:10.1038/s41467-026-72845-3 [article, code]

The membrane-to-cortex distance regulates mDia1 activity to control cortical mechanics.

Revue : Nature communications

Code des auteurs : jvermeil-biophys/cortexplore_publicversion (AGPL-3.0), mahamidlab/actin_cortex_analysis (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 59 fichiers lisibles

[30] doi:10.1038/s41398-026-04426-3 [article, code]

Resting-state brain age is associated with cognitive and sensorimotor abnormalities in schizophrenia spectrum disorders: a validation & longitudinal study.

Revue : Translational psychiatry

Code des auteurs : rpomponio/neuroharmonize (MIT)

Statut : code vérifié, 12 fichiers lisibles

[31] doi:10.1038/s41592-026-03211-w [article, code]

Spatial isoform sequencing at single-cell resolution reveals cell-type-specific spatial isoform variability in multiple brain cell types.

Revue : Nature methods

Code des auteurs : dmcable/spacexr (AGPL-3.0), noush-joglekar/scisorseqr (MIT), algbio/spl-isoquant (GPL-2.0), tilgnerlab/spl-isofind (MIT), tilgnerlab/spl-isofind_reproducibility (MIT)

Statut : code vérifié, 347 fichiers lisibles

[32] doi:10.1016/j.isci.2026.117436 [article, code]

An auditory "low road" for threat processing in humans sensitive to fast temporal cues.

Revue : iScience

Code des auteurs : martinatrisia/subemocond (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 12 fichiers lisibles

[33] doi:10.17912/micropub.biology.002204 [article, code]

Against All Odds: Computational Screening Via Machine Learning Ranking and Generation of Antibody Candidates for Creutzfeldt-Jakob Disease.

Revue : microPublication biology

Code des auteurs : axy-lis/cjd_ml_aao (sans licence)

Statut : lien mort

Jeudi 3 septembre 2026 (15 articles)

[34] doi:10.7554/elife.108408 [article, code]

Frequency and laminar profile of feature-specific visual activity revealed by interleaved EEG-fMRI.

Revue : eLife

Code des auteurs : tommyclausner/laminarfmriv2 (MIT), Zenodo 7211757 (autre-ouverte), tommyclausner/mri-volume-masker-3000-tm (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 209 fichiers lisibles

[35] doi:10.7554/elife.109104 [article, code]

Complementary vertebrate <i>Wac</i> models exhibit phenotypes relevant to DeSanto-Shinawi Syndrome.

Revue : eLife

Code des auteurs : nordneurogenomicslab/publications (sans licence)

Statut : code vérifié, 14 fichiers lisibles

[36] doi:10.1371/journal.pcbi.1014672 [article, code]

Robust circular cluster-based statistics for respiration-brain coupling.

Revue : PLoS computational biology

Code des auteurs : leonardoricci/iaaft (AGPL-3.0), teresaberther/respmethods (sans licence)

Statut : code vérifié, 42 fichiers lisibles

[37] doi:10.1073/pnas.2532946123 [article, code]

<i>Hex</i>-MASP for mapping the whole-tissue spatial proteome and the intrabrain distribution of monoclonal antibodies.

Revue : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Code des auteurs : junqu-lab/masp (Apache-2.0)

Statut : code vérifié, 10 fichiers lisibles

[38] doi:10.1371/journal.pcbi.1014722 [article, code]

Balanced DNA interpolation improves learning of genetic distance-informed embeddings in plants.

Revue : PLoS computational biology

Code des auteurs : lmkoesters/dnainterpolator (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 35 fichiers lisibles

[39] doi:10.1371/journal.pcbi.1014771 [article, code]

A unified framework for potency-oriented AMP discovery via multi-modal learning and guided sequence synthesis.

Revue : PLoS computational biology

Code des auteurs : zhangwy49/multi-task-amp-discriminator-based-on-multi-scale-feature-fusion-and-amp-generator-guided-by-mic (Apache-2.0)

Statut : code vérifié, 33 fichiers lisibles

[40] doi:10.1162/imag.a.1354 [article, code]

Development of a 24-channel 3T phased-array coil for fMRI in awake monkeys: Mitigating spatiotemporal artifacts in ferumoxytol-weighted functional connectivity estimation.

Revue : Imaging neuroscience (Cambridge, Mass.)

Code des auteurs : riken-bcil/bcil (sans licence)

Statut : code vérifié, 12 fichiers lisibles

[41] doi:10.1162/imag.a.1353 [article, code]

Model-based cardiac field artefact correction for OP-MEG.

Revue : Imaging neuroscience (Cambridge, Mass.)

Code des auteurs : Zenodo 20209782 (MIT), sascha-woelk/opm-cfa-correction (MIT)

Statut : code vérifié, 28 fichiers lisibles

[42] doi:10.1162/imag.a.1349 [article, code]

Rapid cortical mapping with cross-participant encoding models.

Revue : Imaging neuroscience (Cambridge, Mass.)

Code des auteurs : huthlab/rapid-cortical-mapping (sans licence)

Statut : code vérifié, 29 fichiers lisibles

[43] doi:10.1111/2041-210x.70411 [article, code]

Mind(the)Plant: An expandable multimodal facility for the integrated characterization of plant behaviour.

Revue : Methods in ecology and evolution

Code des auteurs : Zenodo 22095454 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié

[44] doi:10.1038/s41467-026-77318-1 [article, code]

Offline generative network reconfiguration guides insight-like accelerated learning by assimilation into schema in rats.

Revue : Nature communications

Code des auteurs : gdylab/gdylabcode (sans licence)

Statut : code vérifié, 200 fichiers lisibles

[45] doi:10.1016/j.isci.2026.117438 [article, code]

Systematic assessment of text summarization methods for biomedical literature from frequency methods to language models.

Revue : iScience

Code des auteurs : Zenodo 21840194 (CC-BY-4.0), delta4ai/llmtextsummarizationbenchmark (sans licence)

Statut : code vérifié, 43 fichiers lisibles

[46] doi:10.3389/fsysb.2026.1873899 [article, code]

A systems microbiology framework for reproducible multi-dataset omics integration with application to long COVID.

Revue : Frontiers in systems biology

Code des auteurs : steppenwolf0/longcovidmccrefs (MIT)

Statut : code vérifié, 35 fichiers lisibles

[47] doi:10.3389/fneur.2026.1796739 [article, code]

Network localization of regional intrinsic neural activity alterations in migraine and their neurochemical correlates.

Revue : Frontiers in neurology

Code des auteurs : juryxy/juspace (sans licence)

Statut : code vérifié, 21 fichiers lisibles

[48] doi:10.3389/fnins.2026.1907950 [article, code]

Studying dynamic sound source localization in a virtual maze with EEG and psychophysics.

Revue : Frontiers in neuroscience

Code des auteurs : osf:ymgw3 (sans licence)

Statut : code vérifié, 2 fichiers lisibles

Mercredi 2 septembre 2026 (22 articles)

[49] doi:10.1523/jneurosci.0889-25.2026 [article, code]

Neural Evidence for Action-Related Somatosensory Predictions.

Revue : The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience

Code des auteurs : osf:yw8sa (sans licence)

Statut : code trouvé, pas encore vérifié

[50] doi:10.1523/jneurosci.0295-26.2026 [article, code]

Detection and Removal of Hyper-synchronous Artifacts in Massively Parallel Spike Recordings.

Revue : The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience

Code des auteurs : doi 10.12751/incf.ni2018.0019 (sans licence)

Statut : code vérifié

[51] doi:10.7554/elife.111876 [article, code]

Distinct sensorimotor encoding in tuft dendrites and somata associated with action, correction, and learning.

Revue : eLife

Code des auteurs : kerlin-lab/tstracker (sans licence), kerlin-lab/tongue-classification (sans licence), kerlin-lab/scheib_2026 (MIT)

Statut : code vérifié, 511 fichiers lisibles

[52] doi:10.7554/elife.105213 [article, code]

Mesoscale functional architecture in medial posterior parietal cortex.

Revue : eLife

Code des auteurs : web.ece.ucsb.edu/~riichirohira/topbm-2.05 (sans licence), riichirohira/brainmodules (MIT)

Statut : code vérifié, 2 fichiers lisibles

[53] doi:10.7554/elife.104053 [article, code]

Brain cognition gaps reveal associations with dopamine and factors related to brain health through artificial intelligence prediction of functional connectome.

Revue : eLife

Code des auteurs : moresm/ai-based-prediction-of-cognitive-function (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

[54] doi:10.1371/journal.pbio.3003982 [article, code]

No evidence for modulation of the readiness potential by respiratory phase during natural breathing.

Revue : PLoS biology

Code des auteurs : Zenodo 17715626 (CC-BY-4.0), lucasjeaybizot/breathingrp2025 (sans licence)

Statut : code vérifié, 34 fichiers lisibles

[55] doi:10.1371/journal.pcbi.1014730 [article, code]

A unified model of short- and long-term plasticity: Effects on network connectivity and information capacity.

Revue : PLoS computational biology

Code des auteurs : iiroahokainen/sl-stdp (Apache-2.0), Zenodo 22011941 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 58 fichiers lisibles

[56] doi:10.1126/sciadv.aef9406 [article, code]

Fluorescent protein ticker tape (FPTT): Multiplexed recording of transcriptional dynamics in living cells and in vivo.

Revue : Science advances

Code des auteurs : Zenodo 20259137 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié

[57] doi:10.1126/sciadv.aef2894 [article, code]

Human cortical networks trade communication efficiency for computational reliability.

Revue : Science advances

Code des auteurs : fabridamicelli.github.io/echoes (sans licence), netneurotools.readthedocs.io (sans licence), netneurolab.github.io/neuromaps (sans licence), kuffmode/yanat (MIT)

Statut : code vérifié, 5 fichiers lisibles

[58] doi:10.1126/sciadv.adu3955 [article, code]

Defective EV-mediated transport of SHH alters neural fate specification in EPM1 epilepsy.

Revue : Science advances

Code des auteurs : coolbutuseless/ggpattern (autre), veronicamp/defective-ev-mediated-transport-of-shh-alters-neural-fate-specification-in-epm1-epilepsy (MIT), Zenodo 21453507 (MIT)

Statut : code vérifié, 118 fichiers lisibles

[59] doi:10.1126/sciadv.aeb3209 [article, code]

The actomyosin cortex controls t-tubule remodeling in skeletal muscle.

Revue : Science advances

Code des auteurs : Zenodo 28838 (autre-ouverte), tferr/scripts (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 58 fichiers lisibles

[60] doi:10.1126/sciadv.aed2952 [article, code]

Activation of transposable elements is linked to a region- and cell type-specific interferon response in Parkinson's disease.

Revue : Science advances

Code des auteurs : Zenodo 7589548 (autre-ouverte), molecular-neurogenetics.github.io/truster (sans licence), Zenodo 17434560 (CC-BY-4.0), molecular-neurogenetics/pd_asap_garza2025 (MIT)

Statut : code vérifié, 394 fichiers lisibles

[61] doi:10.1038/s41467-026-76569-2 [article, code]

Self-organization of vascularized muscle from bovine embryonic stem cells.

Revue : Nature communications

Code des auteurs : yuyasanaki/nmj-analysis (Apache-2.0), git.embl.de/grp-mif/image-analysis (sans licence), lrpz/vascumap (CC-BY-NC-4.0)

Statut : code vérifié, 20 fichiers lisibles

[62] doi:10.1038/s41467-026-77302-9 [article, code]

Identification and validation of central amygdala FGFR1 as a therapeutic target for alcohol use disorder using single-nucleus sequencing in rats.

Revue : Nature communications

Code des auteurs : leohog/fgfr1_analysis (MIT)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

[63] doi:10.1038/s41467-026-76956-9 [article, code]

Innervated human cardiac muscle model reveals sympathetic drivers of KCNH2-associated arrhythmias.

Revue : Nature communications

Code des auteurs : danihae/bio-image-unet (MIT), danihae/iehm-analysis (MIT)

Statut : code vérifié, 71 fichiers lisibles

[64] doi:10.1038/s41598-026-67450-9 [article, code]

Privacy-preserving intrusion detection in IoT smart homes using a federated hybrid 1D-CNN-LSTM model with explainable AI.

Revue : Scientific reports

Code des auteurs : selhadi88/fedshield-ids (sans licence)

Statut : code vérifié, 30 fichiers lisibles

[65] doi:10.1038/s42003-026-10881-x [article, code]

On variability in local field potentials.

Revue : Communications biology

Code des auteurs : Zenodo 21959626 (MIT), mohsenparto/on_atv_in_lfp (MIT)

Statut : code vérifié, 14 fichiers lisibles

[66] doi:10.1038/s41586-026-10950-5 [article, code]

Explainable deep learning improves human mental models of self-driving cars.

Revue : Nature

Code des auteurs : eoinkenny/cw-net-autonomous-driving (Apache-2.0)

Statut : code vérifié, 16 fichiers lisibles

[67] doi:10.1155/da/8792696 [article, code]

Connectome Gradient-Based Subtyping of Major Depressive Disorder Reveals Distinct Neurobiological and Transcriptomic Signatures.

Revue : Depression and anxiety

Code des auteurs : evarol/hydra (autre), mica-mni/brainspace (BSD-3-Clause), jfortin1/combatharmonization (sans licence)

Statut : code vérifié, 145 fichiers lisibles

[68] doi:10.1038/s44400-026-00125-4 [article, code]

Regulators of interferon-responsive microglia uncovered by Genome-wide CRISPRi screening.

Revue : NPJ dementia

Code des auteurs : immunogenomics/presto (sans licence), reetm09/mixscale (sans licence)

Statut : code vérifié, 45 fichiers lisibles

[69] doi:10.1038/s41467-026-77168-x [article, code]

Cholinergic-dependent dopamine signals in mouse dorsomedial striatum are regulated by frontal but not sensory cortices.

Revue : Nature communications

Code des auteurs : Zenodo 21651635 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 27 fichiers lisibles

[70] doi:10.1016/j.isci.2026.117412 [article, code]

Transcriptomic landscape of microglia in mouse models of social dysfunction and oxytocin-mediated recovery.

Revue : iScience

Code des auteurs : masatsurutani/transcriptomic-landscape-of-microglia-in-mouse-models-of-social-dysfunction-and-oxytocin-mediated (sans licence)

Statut : dépôt vide, 1 fichier lisibles

Mardi 1 septembre 2026 (75 articles)

[71] doi:10.1093/brain/awag032 [article, code]

A rostral prefrontal mediolateral gradient predicts creativity in frontotemporal dementia.

Revue : Brain : a journal of neurology

Code des auteurs : osf:rtnzw (sans licence)

Statut : code vérifié, 7 fichiers lisibles

[72] doi:10.1093/brain/awag039 [article, code]

Mapping the causal chain from genetic risk variants to lipid dysmetabolism in Parkinson's disease.

Revue : Brain : a journal of neurology

Code des auteurs : ruthbpaula/pd_multiomics (sans licence)

Statut : code vérifié, 6 fichiers lisibles

[73] doi:10.1093/brain/awag075 [article, code]

Modelling the temporal evolution of plasma p-tau217, amyloid PET, tau PET and cognition.

Revue : Brain : a journal of neurology

Code des auteurs : therneau/aftmodel (sans licence)

Statut : code vérifié, 6 fichiers lisibles

[74] doi:10.1093/brain/awag131 [article, code]

Data-driven modelling of tau pathology reveals distinct progressive supranuclear palsy subtypes.

Revue : Brain : a journal of neurology

Code des auteurs : jaunmuktanelab (sans licence)

Statut : code vérifié

[75] doi:10.1093/neuonc/noag119 [article, code]

Single-nucleus profiling of postmortem diffuse midline gliomas identifies mitochondrial biogenesis as a resistance mechanism to imipridone therapy.

Revue : Neuro-oncology

Code des auteurs : cancergenomicslab/dmg_onc201 (MIT)

Statut : code vérifié, 9 fichiers lisibles

[76] doi:10.1093/neuonc/noag128 [article, code]

Spatially-resolved single-cell imaging of melanoma brain metastases identifies localized immune patterns predictive of immune checkpoint blockade response.

Revue : Neuro-oncology

Code des auteurs : bodenmillergroup/steinbock (MIT), stefanosvoglis/voglis_et_al_2026_neuro-oncology (sans licence)

Statut : code vérifié, 92 fichiers lisibles

[77] doi:10.1093/eurheartj/ehag374 [article, code]

RNA splicing and cardiovascular disease: a guide for cardiologists.

Revue : European heart journal

Code des auteurs : gaolabtools/heart-isoform-atlas (autre), laptopbiologist/katmap (Apache-2.0)

Statut : code vérifié, 82 fichiers lisibles

[78] doi:10.1093/aje/kwag135 [article, code]

Depressive symptoms and neuroimaging markers of brain aging in an ethno-racially diverse sample: a Bayesian analysis.

Revue : American journal of epidemiology

Code des auteurs : spatialhealth/khandle-star_depression_mri (sans licence)

Statut : code vérifié, 18 fichiers lisibles

[79] doi:10.1093/sleep/zsag168 [article, code]

Deltas' and spindles' cross-area synchronization and ripple subtypes.

Revue : Sleep

Code des auteurs : genzellab/rgs14 (AGPL-3.0), genzellab/rgs14_clusters (sans licence)

Statut : code vérifié, 194 fichiers lisibles

[80] doi:10.1101/gr.281341.125 [article, code]

High-accuracy SNV calling for bacterial isolates using deep learning with AccuSNV.

Revue : Genome research

Code des auteurs : liaoherui/accusnv (MIT), liaoherui/accusnv-eval (sans licence)

Statut : code vérifié, 42 fichiers lisibles

[81] doi:10.1002/glia.70201 [article, code]

Dorso-Ventral and Night-Day Regulation of Extracellular K<sup>+</sup> Dynamics in Mouse Hippocampal Astrocytes.

Revue : Glia

Code des auteurs : nari‐kiani/glia_3740732_data (sans licence), Zenodo 20933397 (CC-BY-4.0), nari-kiani/glia_3740732_data (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 16 fichiers lisibles

[82] doi:10.1101/gr.281686.125 [article, code]

Knowledge-driven interpretable neural networks provide mechanistic insight.

Revue : Genome research

Code des auteurs : yanlarryke/pathnet (sans licence)

Statut : code vérifié, 12 fichiers lisibles

[83] doi:10.1002/nbm.70368 [article, code]

Intra-MRI Head Motion Tracking and Correction: A Quantitative In Vivo Evaluation Framework.

Revue : NMR in biomedicine

Code des auteurs : zzariry/pymocokit (MIT)

Statut : code vérifié, 17 fichiers lisibles

[84] doi:10.1002/pro.70747 [article, code]

Predicting membrane protein localization by deep learning on structure and chemistry.

Revue : Protein science : a publication of the Protein Society

Code des auteurs : bivekpok/gpsfortmds (Apache), huggingface.co/spaces/bivek77/gpsfortmd (MIT)

Statut : code vérifié, 148 fichiers lisibles

[85] doi:10.1002/hipo.70124 [article, code]

Association Between Anterior Hippocampal Gyrification and Episodic Memory Performance in Neurotypical Young Adults.

Revue : Hippocampus

Code des auteurs : khanlab/hippunfold (MIT), mic-dkfz/nnunet (Apache-2.0)

Statut : code vérifié, 259 fichiers lisibles

[86] doi:10.1111/ejn.70660 [article, code]

Intracranial Electrical Stimulation of the Superior Temporal Gyrus Evokes Rapid Responses in Human Visual Cortex.

Revue : The European journal of neuroscience

Code des auteurs : multisensory-lab/msl_ccep_stg2occ (sans licence), multisensory‐lab/msl_ccep_stg2occ (sans licence)

Statut : lien mort

[87] doi:10.1093/gbe/evag222 [article, code]

Genomic Signatures of Selection Are Enriched in Differentially Expressed Genes in Sticklebacks Adapting to Contrasting Environments.

Revue : Genome biology and evolution

Code des auteurs : z0on/tag-based_rnaseq (sans licence)

Statut : code vérifié, 30 fichiers lisibles

[88] doi:10.1002/hbm.70635 [article, code]

Cerebral Cortical Structural Variation and General Cognitive Ability: Evidence From Mendelian Randomization.

Revue : Human brain mapping

Code des auteurs : jianyang-lab/gsmr (sans licence), jianyang‐lab/gsmr (sans licence)

Statut : code vérifié, 6 fichiers lisibles

[89] doi:10.1002/alz.71714 [article, code]

Cross-tissue immune profiling of APOE ε4 reveals early dysregulation in Alzheimer's disease.

Revue : Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association

Code des auteurs : art83/ad_apoe (sans licence)

Statut : lien mort

[90] doi:10.1002/hbm.70608 [article, code]

Transient Elevation and Subsequent Normalization of Brain Age Gap During the Postpartum Period.

Revue : Human brain mapping

Code des auteurs : chang-hyun.park/postpartum-brain-age-prediction (MIT), chang‐hyun.park/postpartum‐brain‐age‐prediction (sans licence)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

[91] doi:10.1002/alz.71773 [article, code]

Brain-derived plasma p-tau217 shows enhanced dynamic range for Alzheimer's disease neuropathological change.

Revue : Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association

Code des auteurs : ysu001/pup (BSD-3-Clause)

Statut : code vérifié, 277 fichiers lisibles

[92] doi:10.1007/s12021-026-09814-0 [article, code]

Application of Machine Learning Models to Identify Differences in Neural Electrophysiological Properties Across Estrous Cycle Phases.

Revue : Neuroinformatics

Code des auteurs : doi 10.5061/dryad.k0p2ngfgm (sans licence), armaan-raina/estrous-phase-classification (MIT)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

[93] doi:10.1371/journal.pbio.3003916 [article, code]

Arousal-driven critical roaming reproduces human functional connectivity dynamics.

Revue : PLoS biology

Code des auteurs : Zenodo 20798972 (CC-BY-4.0), juanitacabral/networkmodel_toolbox (sans licence)

Statut : code vérifié, 37 fichiers lisibles

[94] doi:10.1371/journal.pone.0357492 [article, code]

Confidence-guided integration of otoscopy videos and tympanometry for middle ear disease diagnosis: A multi-center otoscopy study with external paired-cohort evaluation.

Revue : PloS one

Code des auteurs : cair-lab-wfusm/otoscope_mmmc (sans licence)

Statut : code vérifié, 13 fichiers lisibles

[95] doi:10.1371/journal.pone.0355829 [article, code]

Physically aligned forest fire risk prediction: A deep learning framework coupling fuel and climate multivariate factors.

Revue : PloS one

Code des auteurs : cbjyb/fwimsnet-forest-fire-risk-prediction-framework (MIT)

Statut : code vérifié, 10 fichiers lisibles

[96] doi:10.1371/journal.pbio.3003979 [article, code]

Impaired midfrontal‑motor theta phase synchronization characterizes maladaptive motivational behavior in people with obsessive‑compulsive disorder.

Revue : PLoS biology

Code des auteurs : Zenodo 21964069 (MIT), yupang11/motivational-biases-in-ocd (MIT)

Statut : code vérifié, 115 fichiers lisibles

[97] doi:10.1371/journal.pone.0350720 [article, code]

LENS: A mammography-specific hybrid CNN-Transformer with lesion-aware evidence modeling.

Revue : PloS one

Code des auteurs : hoangducquy93/lens (Apache-2.0)

Statut : dépôt vide, 2 fichiers lisibles

[98] doi:10.1371/journal.pcbi.1014707 [article, code]

From sequences to strategies: Early detection of new SARS-CoV-2 variants via genetic distance to reduce hospitalizations.

Revue : PLoS computational biology

Code des auteurs : marikadavanzo/sars-cov-2-variant-early-detection-genetic-distance (MIT)

Statut : code vérifié, 11 fichiers lisibles

[99] doi:10.1371/journal.pone.0356765 [article, code]

Binocular combination in the autonomic nervous system.

Revue : PloS one

Code des auteurs : osf:gdvt4 (sans licence)

Statut : code vérifié, 12 fichiers lisibles

[100] doi:10.1073/pnas.2609814123 [article, code]

Genetic architectures of brain-related traits are shaped by strong selective constraints.

Revue : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Code des auteurs : bulik/ldsc (AGPL-3.0), huishengz/cns-selection (sans licence)

Statut : code vérifié, 72 fichiers lisibles

[101] doi:10.1101/gr.280394.124 [article, code]

De novo structural variants in autism spectrum disorder disrupt distal regulatory interactions of neuronal genes.

Revue : Genome research

Code des auteurs : ketringjoni/supremo (sans licence)

Statut : code vérifié, 16 fichiers lisibles

[102] doi:10.1038/s41467-026-77248-y [article, code]

The mPFC-reuniens-hippocampus pathway links brain circuitry and neural plasticity in antidepressant response.

Revue : Nature communications

Code des auteurs : mveleanu/veleanu_et_al (MIT), Zenodo 21111701 (MIT)

Statut : code vérifié, 22 fichiers lisibles

[103] doi:10.1038/s43856-026-01817-x [article, code]

Visual prompt engineering for multimodal and irregularly sampled medical data.

Revue : Communications medicine

Code des auteurs : Zenodo 20786553 (CC-BY-4.0), cardio-ai/vitimm (sans licence)

Statut : code vérifié, 34 fichiers lisibles

[104] doi:10.1186/s40478-026-02415-7 [article, code]

A standardized framework resolves ambiguity in motor neuron loss across neurodegenerative diseases.

Revue : Acta neuropathologica communications

Code des auteurs : a-l-norman/smn-delta-7-meta-analysis-r-code (sans licence), gerstnerf/counting-simulation (sans licence)

Statut : code vérifié, 4 fichiers lisibles

[105] doi:10.1002/advs.77524 [article, code]

MethyAnno: An Interpretable Automated Annotation Method Leveraging Multi-Scale Information and Metric Learning Framework for scDNAm Data.

Revue : Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)

Code des auteurs : biox-nku/methyanno (MIT), biox‐nku/methyanno (sans licence)

Statut : code vérifié, 22 fichiers lisibles

[106] doi:10.1002/hbm.70627 [article, code]

Investigating the Contribution of Molecular-Enriched Functional Connectivity to Brain-Age Analysis.

Revue : Human brain mapping

Code des auteurs : ottaviadipasquale/react-fmri (MIT), ottaviadipasquale/react‐fmri (sans licence)

Statut : code vérifié, 5 fichiers lisibles

[107] doi:10.1162/imag.a.1342 [article, code]

Hyperpolarized <sup>13</sup>C-bicarbonate production correlates with excitatory neuron distribution in the human brain.

Revue : Imaging neuroscience (Cambridge, Mass.)

Code des auteurs : Zenodo 20575695 (CC-BY-4.0), brinuthayakumar/hpmr-genetranscript_imagingneuroscience (sans licence)

Statut : code vérifié, 19 fichiers lisibles

[108] doi:10.1093/cercor/bhag132 [article, code]

Spatiotemporal white-matter development across early childhood.

Revue : Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)

Code des auteurs : mervsingh/alongtract_fba_wm_dev (sans licence)

Statut : code vérifié, 67 fichiers lisibles

[109] doi:10.1016/j.dcn.2026.101806 [article, code]

Same ages, different stages: Pubertal development in 9- and 10-year olds is associated with entropy of fMRI signals.

Revue : Developmental cognitive neuroscience

Code des auteurs : dcan-labs/abcd-hcp-pipeline (BSD-3-Clause)

Statut : code vérifié, 8 fichiers lisibles

[110] doi:10.1016/j.nicl.2026.104053 [article, code]

Childhood white matter organization predicts adolescent internalizing problems among youth with and without ADHD.

Revue : NeuroImage. Clinical

Code des auteurs : chydedeakin/hyde_et_al_2026 (sans licence)

Statut : code vérifié, 1 fichier lisibles

[111] doi:10.1111/psyp.70385 [article, code]

Exploring EEG and ECG in Music Listening: A Scoping Review.

Revue : Psychophysiology

Code des auteurs : Zenodo 22827658 (MIT), scottleimroth/eeg-ecg-music-review-agent (autre), Zenodo 22827659 (MIT)

Statut : code vérifié, 36 fichiers lisibles

[112] doi:10.1002/cns.71147 [article, code]

Unveiling the Distinctive Brain Functional Dynamics Between Parkinson's Disease and Progressive Supranuclear Palsy.

Revue : CNS neuroscience & therapeutics

Code des auteurs : netneurolab/neuromaps (CC-BY-NC-SA-4.0), shijh123456/pd_psp (sans licence)

Statut : code vérifié, 70 fichiers lisibles

[113] doi:10.1002/hbm.70628 [article, code]

EEG Biomarkers for Affective Disorders Diagnosis: An Evaluation and Validation Study.

Revue : Human brain mapping

Code des auteurs : yt-liu88/eegbiomarkers-for-affective-disorders-diagnosis (sans licence), yt‐liu88/eegbiomarkers‐for‐affective‐disorders‐diagnosis (sans licence)

Statut : code vérifié, 5 fichiers lisibles

[114] doi:10.1111/jne.70257 [article, code]

A symmetric systemic challenge elicits a right-biased response mediated by vasopressin signaling.

Revue : Journal of neuroendocrinology

Code des auteurs : yaromirko/biostatistics-wd (MIT)

Statut : code vérifié, 25 fichiers lisibles

[115] doi:10.1111/mec.70527 [article, code]

Epigenetic Changes Associated With a Phenotypic Transition in Namibian Cheetahs.

Revue : Molecular ecology

Code des auteurs : vullioud/vullioud_et_al_2026_molecular_ecology_scripts (sans licence)

Statut : code vérifié, 20 fichiers lisibles

[116] doi:10.1111/psyp.70397 [article, code]

Cortical Contributions to Attentional Orienting and Response Cancellation in Action Stopping.

Revue : Psychophysiology

Code des auteurs : osf:ztb5m (sans licence)

Statut : code vérifié, 1 fichier lisibles

[117] doi:10.1093/cercor/bhag121 [article, code]

Preserved intrinsic neural timescale organization with hierarchical variation in autism spectrum disorder.

Revue : Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)

Code des auteurs : shikauchiy/int-hierarchy-analysis (sans licence)

Statut : code vérifié, 4 fichiers lisibles

[118] doi:10.1093/bib/bbag476 [article, code]

Interpretable deep neural network identifies robust biomarkers for diseases with mechanistic insights from omics data.

Revue : Briefings in bioinformatics

Code des auteurs : gregbellan/stabl (BSD-3-Clause), zixuans/survnet (MIT), zifanzhu/deeplink (AGPL-3.0), peyman-hk/de-randomized-hide-mk (AGPL-3.0), zlyx26/deepvaris (sans licence)

Statut : code vérifié, 139 fichiers lisibles

[119] doi:10.1093/bib/bbag475 [article, code]

Dynamic multimodal survival prediction in multiple myeloma integrating gene expression, longitudinal laboratory measurements, and treatment history.

Revue : Briefings in bioinformatics

Code des auteurs : shangrujia/multi_mm (sans licence)

Statut : code vérifié, 22 fichiers lisibles

[120] doi:10.1002/minf.70053 [article, code]

SMILES2Docking: An Open-Source Desktop Workflow for Ligand Ionization, Stereochemistry-Aware Preparation and Semi-Empirical 3D Refinement.

Revue : Molecular informatics

Code des auteurs : amgoncalvesusp/smiles2docking (GPL-2.0)

Statut : code vérifié, 82 fichiers lisibles

[121] doi:10.1021/acs.jctc.6c00808 [article, code]

Enabling Biomolecular Simulations with Neural Network Potentials in GROMACS.

Revue : Journal of chemical theory and computation

Code des auteurs : lmuellender/gmx-nnpot-tools (sans licence), Zenodo 19663881 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 16 fichiers lisibles

[122] doi:10.1098/rsob.260120 [article, code]

Assessment of adult structural plasticity in Drosophila neurons.

Revue : Open biology

Code des auteurs : frantassara/morphoscope (MIT), Zenodo 17901990 (CC-BY-4.0), doi 10.6084/m9.figshare.c.8627737 (sans licence)

Statut : code vérifié, 11 fichiers lisibles

[123] doi:10.1093/bib/bbag481 [article, code]

engGNN: a dual-graph neural network for omics-based disease classification and feature selection.

Revue : Briefings in bioinformatics

Code des auteurs : tiantiy/enggnn (sans licence)

Statut : code vérifié, 2 fichiers lisibles

[124] doi:10.1111/exd.70356 [article, code]

AI-Based Segmentation of Wound Types Caused by Epidermolysis Bullosa.

Revue : Experimental dermatology

Code des auteurs : georgwimmer/eb-segmentation-mask2former (CC0-1.0), georgwimmer/eb‐segmentation‐mask2former (sans licence)

Statut : code vérifié, 5 fichiers lisibles

[125] doi:10.1093/bib/bbag491 [article, code]

MSF-HierGNN: a multi-source substructure-fusion hierarchical GNN method and web server to predict molecular property for drug design.

Revue : Briefings in bioinformatics

Code des auteurs : flymetothestar11/msf-hiergnn-source-code.see (sans licence)

Statut : lien mort

[126] doi:10.1093/bib/bbag490 [article, code]

Systematic benchmarking and optimal strategy selection of cross-species integration methods.

Revue : Briefings in bioinformatics

Code des auteurs : figshare:31976259 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 37 fichiers lisibles

[127] doi:10.1093/bib/bbag489 [article, code]

PMPIHGLL: predicting metabolite-protein interactions using dual hypergraph convolutional networks and large language models.

Revue : Briefings in bioinformatics

Code des auteurs : ztjin958/pmpihgll (sans licence)

Statut : code vérifié, 30 fichiers lisibles

[128] doi:10.1111/jnc.70551 [article, code]

Synaptobrevin-2 Containing Extracellular Vesicles Are Rapidly Incorporated Into Mammalian Neurons via a Dynamin-Dependent Pathway.

Revue : Journal of neurochemistry

Code des auteurs : melikelakadamyali/stormanalysissoftware (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 243 fichiers lisibles

[129] doi:10.1002/alz.71823 [article, code]

Cellular transcriptomic signatures underpinning the heterogeneity of depression in Alzheimer's disease.

Revue : Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association

Code des auteurs : nctrailrunner/nps_manuscript (sans licence)

Statut : code vérifié, 23 fichiers lisibles

[130] doi:10.1002/alz.71822 [article, code]

SynthPET: A 3D generative AI approach for FDG-PET image synthesis from T1-weighted MRI and ASL CBF in Alzheimer's disease.

Revue : Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association

Code des auteurs : adni.loni.usc.edu/data‐samples/access‐data (sans licence)

Statut : lien mort

[131] doi:10.1093/braincomms/fcag334 [article, code]

Functional and effective connectivity alterations relate to cognitive performance in aquaporin-4 antibody-positive neuromyelitis optica spectrum disorder.

Revue : Brain communications

Code des auteurs : pzeidman/dcm-peb-example (sans licence)

Statut : code vérifié, 7 fichiers lisibles

[132] doi:10.1016/j.jmro.2026.100225 [article, code]

Feasibility, image quality, and analytic usability of mobile 64 mT ultra-low-field MRI for infant brain imaging at 3 and 12 months in southern Malawi.

Revue : Journal of magnetic resonance open

Code des auteurs : unity-physics (sans licence)

Statut : code vérifié

[133] doi:10.1021/acs.jcim.6c01299 [article, code]

Targeting BCL-2 through Deep Learning-Based Drug Repurposing: A Multimodal Approach Combining Diffusion-Based Generative Modeling, Neural Relational Inference, and In Vitro Validation.

Revue : Journal of chemical information and modeling

Code des auteurs : durdagilab/neuralplexer_ligand_scoring (MIT), durdagilab/automate-neural-relational-inference-nri- (MIT)

Statut : code vérifié, 17 fichiers lisibles

[134] doi:10.1021/acs.jcim.6c00728 [article, code]

Differentiable Thermodynamic Phase-Equilibria for Machine Learning.

Revue : Journal of chemical information and modeling

Code des auteurs : git.rwth-aachen.de/avt-svt/public (sans licence)

Statut : code vérifié

[135] doi:10.1021/acs.jcim.6c01847 [article, code]

Toward Imbalanced Molecular Property Regression: A Benchmark Study and Interval-Aware Mixture of Experts.

Revue : Journal of chemical information and modeling

Code des auteurs : syan1992/interval-aware-mixture-of-expert (sans licence)

Statut : code vérifié, 6 fichiers lisibles

[136] doi:10.1001/jamanetworkopen.2026.33507 [article, code]

Illness Severity and Longitudinal Gray Matter Volumes Among People With Major Depressive Disorder.

Revue : JAMA network open

Code des auteurs : osf:rcfq7 (sans licence)

Statut : dépôt vide

[137] doi:10.1093/bib/bbag485 [article, code]

Single-cell-level perturbation-induced and condition-related signal estimation with batch effect removal using NDreamer.

Revue : Briefings in bioinformatics

Code des auteurs : lugia-xiao/ndreamer (AGPL-3.0), lugia-xiao/ndreamer_reproducible (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 46 fichiers lisibles

[138] doi:10.1093/ageing/afag263 [article, code]

Cardiometabolic medication exposures and cognitive outcomes in Alzheimer's disease.

Revue : Age and ageing

Code des auteurs : sabrina-wyh/multicohort-medication-ad (sans licence)

Statut : code vérifié, 17 fichiers lisibles

[139] doi:10.3389/fvets.2026.1881772 [article, code]

Automated analysis of feline posture using deep learning and geometric modeling.

Revue : Frontiers in veterinary science

Code des auteurs : facebookresearch/detectron2 (Apache-2.0)

Statut : code vérifié, 533 fichiers lisibles

[140] doi:10.1111/ejn.70670 [article, code]

Cross-Night Modulation of Change Detection ERPs to Foreign Speech Sound Features During N2 Sleep.

Revue : The European journal of neuroscience

Code des auteurs : asophiliachance/sleep_exposure (sans licence)

Statut : code vérifié, 12 fichiers lisibles

[141] doi:10.1098/rstb.2024.0461 [article, code]

Shallow recurrent decoders for neural and behavioural dynamics.

Revue : Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences

Code des auteurs : amysrude/neuralshred (sans licence), meganebers/mobileshred (sans licence)

Statut : code vérifié, 27 fichiers lisibles

[142] doi:10.1093/cercor/bhag110 [article, code]

Flexibility of internal attention: divergent spatiotemporal profiles for feature and object cueing.

Revue : Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)

Code des auteurs : osf:vxpsb (sans licence)

Statut : code vérifié, 16 fichiers lisibles

[143] doi:10.1111/jnc.70552 [article, code]

Altered Retinal Dopamine Homeostasis in Murine Models of Retinitis Pigmentosa.

Revue : Journal of neurochemistry

Code des auteurs : umairseemab/rnaseqdata (sans licence)

Statut : code vérifié, 4 fichiers lisibles

[144] doi:10.1002/hipo.70131 [article, code]

Decoding Medial Entorhinal Cortical Dynamics Produces Planning-Like Alternations in Hippocampal theta Sequences.

Revue : Hippocampus

Code des auteurs : Zenodo 18340856 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 20 fichiers lisibles

[145] doi:10.1002/eap.70317 [article, code]

Prioritizing removals of a highly cryptic invasive species using machine learning and demographic weighting.

Revue : Ecological applications : a publication of the Ecological Society of America

Code des auteurs : Zenodo 21416777 (MIT), asromer-biology/romer_et_al_2026_python_prioritization (MIT)

Statut : code vérifié, 10 fichiers lisibles

Samedi 1 août 2026 (31 articles)

[146] doi:10.1002/alz.71745 [article, code]

Regional astrocyte dysregulation and altered glymphatic-related markers in Alzheimer's disease frontal cortex.

Revue : Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association

Code des auteurs : xanthippilouka/human_brain_image_analysis (sans licence)

Statut : code vérifié, 8 fichiers lisibles

[147] doi:10.1002/brb3.71667 [article, code]

Exploring Gray Matter Alterations in Post-Stroke Patients: A Structural Covariance Analysis.

Revue : Brain and behavior

Code des auteurs : jlhos-fmri/braincovarianceconnecttoolkitv2.1 (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 189 fichiers lisibles

[148] doi:10.1002/brb3.71659 [article, code]

Offset Analgesia and Onset Hyperalgesia: A Comparison Between Women With Non-Suicidal Self-Injury and Healthy Women.

Revue : Brain and behavior

Code des auteurs : osf:x8hjk (sans licence)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

[149] doi:10.1093/bioinformatics/btag613 [article, code]

ECLIPSE: exploring the dark proteome of ESKAPE pathogens through the sequence similarity network of the Protein Universe Atlas.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : surabhilata/eclipse (MIT)

Statut : code vérifié, 6 fichiers lisibles

[150] doi:10.1093/europace/euag158 [article, code]

Optogenetic tachypacing facilitates burst-induced arrhythmia in stem cell-derived human atrial engineered heart tissue.

Revue : Europace : European pacing, arrhythmias, and cardiac electrophysiology : journal of the working groups on cardiac pacing, arrhythmias, and cardiac cellular electrophysiology of the European Society of Cardiology

Code des auteurs : owlcap0ne/pacer_led_board (sans licence)

Statut : dépôt vide, 1 fichier lisibles

[151] doi:10.1167/jov.26.8.4 [article, code]

The neural processes of illusory occlusion in object recognition.

Revue : Journal of vision

Code des auteurs : osf:x6fv9 (sans licence)

Statut : code vérifié, 13 fichiers lisibles

[152] doi:10.1093/bioinformatics/btag607 [article, code]

A data-driven evaluation of optimization techniques in cell culture media.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : amii-applied-ai/amii-cell-ag-tools (MIT), Zenodo 21501659 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 52 fichiers lisibles

[153] doi:10.1093/cercor/bhag125 [article, code]

Heritable and experience-dependent cortical traits of reading ability.

Revue : Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)

Code des auteurs : mikaelroll/corticalreading (MIT)

Statut : code vérifié, 5 fichiers lisibles

[154] doi:10.1111/ejn.70659 [article, code]

Premovement Suppression of Corticospinal Excitability Is Modulated by Reaction Time Task Requirements.

Revue : The European journal of neuroscience

Code des auteurs : doi 10.7910/dvn/qn0n2g (sans licence)

Statut : code trouvé, pas encore vérifié

[155] doi:10.1093/bioinformatics/btag424 [article, code]

SlotDeconv: spatial transcriptomics deconvolution via diversity-constrained prototype learning and spatial refinement.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : hannahnjit/slotdeconv (MIT)

Statut : code vérifié, 8 fichiers lisibles

[156] doi:10.1093/bioinformatics/btag498 [article, code]

GiantHost: a domain-adaptive and uncertainty-aware framework for giant virus host prediction.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : fuchuanqu/gianthost (sans licence)

Statut : code vérifié, 17 fichiers lisibles

[157] doi:10.1093/bioinformatics/btag448 [article, code]

Stoic: fast and accurate protein stoichiometry prediction.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : pickybinders/stoic (MIT)

Statut : code vérifié, 34 fichiers lisibles

[158] doi:10.1093/bioinformatics/btag592 [article, code]

Network-based stratification of allele-specific expression reveals patient subgroups in Huntington's disease.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : macsbio/hd-ase-nbs (MIT)

Statut : code vérifié, 40 fichiers lisibles

[159] doi:10.1093/bioinformatics/btag413 [article, code]

Tail-aware heterogeneous graph neural networks for multi-class drug-drug interaction prediction.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : varshagnanasekar/ddi_prediction (sans licence)

Statut : code vérifié, 24 fichiers lisibles

[160] doi:10.1093/bioinformatics/btag430 [article, code]

SPIDER: spatially integrated denoising via embedding regularization with single cell supervision.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : Zenodo 20613921 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 11 fichiers lisibles

[161] doi:10.1093/bioinformatics/btag411 [article, code]

Knowledge-guided learning with curated prior genetic biomarkers for robust model interpretation.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : datax-lab/bioexpl (sans licence)

Statut : code vérifié, 7 fichiers lisibles

[162] doi:10.1093/bioinformatics/btag479 [article, code]

An end-to-end computational framework for "Record-seq" transcriptional recording data.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : plattlab/record-seq-framework (MIT)

Statut : code vérifié, 5 fichiers lisibles

[163] doi:10.1093/bioinformatics/btag431 [article, code]

Pocket-PROTACs: an interpretable pocket-aware deep learning framework for predicting PROTAC-induced protein degradation.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : adochew/pocket-protacs (sans licence)

Statut : code vérifié, 24 fichiers lisibles

[164] doi:10.1093/bioinformatics/btag629 [article, code]

Unified representation learning for spatial multi-omics.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : vitaintelli-cqu/spaalign (sans licence), Zenodo 20250508 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 30 fichiers lisibles

[165] doi:10.1093/cercor/bhag117 [article, code]

Spontaneous changes in the prestimulus alpha power predict both objective and subjective aspects of perception-evidence from 4 paradigms and 471 experimental sessions.

Revue : Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)

Code des auteurs : osf:54zqj (sans licence)

Statut : dépôt vide

[166] doi:10.1093/nar/gkag788 [article, code]

Neuronal activity-driven 3D chromatin dynamics in cortical pyramidal neurons depend on SATB2.

Revue : Nucleic acids research

Code des auteurs : sespesogil/satb2_3d_genome (sans licence), ay-lab/dchic (MIT), ali-mujahid/satb2-3d-genome-organization (sans licence), Zenodo 21534635 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 29 fichiers lisibles

[167] doi:10.1002/alz.71760 [article, code]

Chronic stress, social support, and domain-specific cognitive decline in HABS-HD.

Revue : Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association

Code des auteurs : jkleeri/mielkelab_chronicstress_socialsupport_habshd (sans licence)

Statut : code vérifié, 2 fichiers lisibles

[168] doi:10.1002/cns.71114 [article, code]

Dynamic Functional Connectivity Changes in Cortical and Cortico-Striatal Strokes in Mice.

Revue : CNS neuroscience & therapeutics

Code des auteurs : aswendt-lab/aidamri (AGPL-3.0), doi 10.12751/g-node.pmvtz1 (sans licence), doi 10.12751/g‐node.pmvtz1 (sans licence)

Statut : code vérifié, 110 fichiers lisibles

[169] doi:10.1038/s41467-026-75882-0 [article, code]

A massively parallel CRISPR-based screening platform for modifiers of neuronal depolarization.

Revue : Nature communications

Code des auteurs : noamteyssier/sgcount (MIT), noamteyssier/crispr_screen (MIT), noamteyssier/adpbulk (MIT), noamteyssier/cshift (MIT), noamteyssier/idea (MIT), Zenodo 12774353 (CC-BY-4.0), Zenodo 12774305 (CC-BY-4.0), Zenodo 20736458 (MIT), Zenodo 20736463 (MIT), Zenodo 20736467 (MIT)

Statut : code vérifié, 140 fichiers lisibles

[170] doi:10.1021/acs.jcim.6c01482 [article, code]

Predicting Enzyme pH Optima from Structure Using Equivariant Graph Neural Networks.

Revue : Journal of chemical information and modeling

Code des auteurs : Zenodo 18405148 (CC-BY-4.0), kuenzelab/phoptnn (MIT)

Statut : code vérifié, 41 fichiers lisibles

[171] doi:10.1021/acs.jcim.6c01219 [article, code]

Integrating AI and Molecular Modeling for Structural Prediction of a Closed-Pore State of the hERG Channel.

Revue : Journal of chemical information and modeling

Code des auteurs : robincorey/herg_closed_md (sans licence)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

[172] doi:10.1021/acs.jcim.6c01374 [article, code]

Odor-Sight: An Interpretable Graph Neural Network Web Platform for Prediction of Odorant Activity.

Revue : Journal of chemical information and modeling

Code des auteurs : labmolufg/odorsight (sans licence)

Statut : code vérifié, 9 fichiers lisibles

[173] doi:10.1167/jov.26.8.9 [article, code]

Subspace reverse-correlation estimation of receptive fields during free viewing.

Revue : Journal of vision

Code des auteurs : figshare:32257377 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 1 fichier lisibles

[174] doi:10.1093/bioinformatics/btag652 [article, code]

mmVelo: a deep generative model for estimating cell state-dependent dynamics across multiple modalities.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Code des auteurs : nomuhyooon/mmvelo (sans licence), Zenodo 20103609 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 170 fichiers lisibles

[175] doi:10.1021/acs.jmedchem.6c01461 [article, code]

Dual Inhibitors of p38α Mitogen-Activated Protein Kinase and Butyrylcholinesterase for the Modulation of Neuroinflammation and Cognitive Dysfunction.

Revue : Journal of medicinal chemistry

Code des auteurs : rcsb.org/structure/9d8g (sans licence), rcsb.org/structure/9d6p (sans licence), pubs.acs.org/doi/suppl (sans licence)

Statut : code vérifié

[176] doi:10.1117/1.nph.13.s3.s32603 [article, code]

SNIRF2BIDS: a GUI-based tool for converting functional near-infrared spectroscopy data to the Brain Imaging Data Structure in R.

Revue : Neurophotonics

Code des auteurs : raphael-lorenzdelaigue/snirf2bids (sans licence)

Statut : code vérifié, 8 fichiers lisibles

Date inconnue (24 articles)

[177] doi:10.1038/s41598-025-29587-x [article, code]

Evaluating EEG-to-text models through noise-based performance analysis

Revue : —

Code des auteurs : khu-aims/eeg-to-text (sans licence)

Statut : code vérifié, 26 fichiers lisibles

[178] doi:10.1038/s41598-025-28583-5 [article, code]

SmartERD: a pipeline for referencing subjects to a common peak in the analysis of ERD dynamics

Revue : —

Code des auteurs : Zenodo 17534724 (GPL-3.0), sdpenna66/smarterd (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 10 fichiers lisibles

[179] doi:10.1162/imag.a.1034 [article, code]

Top-down selection of visual working memory contents is supported by alpha-band phase-synchronized oscillatory networks

Revue : —

Code des auteurs : palvalab/vwm_synchronization (sans licence), doi 10.5061/dryad.np5hqc00n (sans licence)

Statut : code vérifié, 15 fichiers lisibles

[180] doi:10.1073/pnas.2510015122 [article, code]

Mapping epileptogenic brain using a unified spatial–temporal–spectral source imaging framework

Revue : —

Code des auteurs : bfinl/stsi (CC-BY-NC-SA-4.0)

Statut : code vérifié, 17 fichiers lisibles

[181] doi:10.1038/s41597-025-06397-4 [article, code]

MEG-SCANS - A comprehensive magnetoencephalography speech dataset with Stories, Chirps and Noisy Sentences

Revue : —

Code des auteurs : tillhabersetzer/meg-scans (BSD-3-Clause), Zenodo 17397581 (BSD-3-Clause)

Statut : code vérifié, 94 fichiers lisibles

[182] doi:10.1371/journal.pone.0337726 [article, code]

Classification of chronic pain and spinal cord stimulation response using machine learning in magnetoencephalography data

Revue : —

Code des auteurs : Zenodo 3840534 (Apache-2.0), mstarmans91/worc (Apache-2.0)

Statut : code vérifié, 370 fichiers lisibles

[183] doi:10.1162/imag.a.1040 [article, code]

Novel 4 He-OPMs support waveform-specific beta burst analysis comparable to SQUID-MEG

Revue : —

Code des auteurs : tgutteling/opm_motor (sans licence), danclab/burst_detection (sans licence)

Statut : code vérifié, 25 fichiers lisibles

[184] doi:10.1016/j.isci.2025.113806 [article, code]

Beta-band frequency shifts signal decisions in human prefrontal cortex

Revue : —

Code des auteurs : osf:a5m7q (sans licence)

Statut : code vérifié, 3 fichiers lisibles

[185] doi:10.7554/elife.106753 [article, code]

Traveling waves across scales: Different mechanisms but same canonical computation?

Revue : —

Code des auteurs : fchavane/model_tw (sans licence)

Statut : code vérifié, 2 fichiers lisibles

[186] doi:10.1111/ejn.70255 [article, code]

A Systematic Review of Aperiodic Neural Activity in Clinical Investigations

Revue : —

Code des auteurs : tomdonoghue/aperiodicclinical (MIT)

Statut : code vérifié, 12 fichiers lisibles

[187] doi:10.7554/elife.100605 [article, code]

Age-related changes in ‘cortical’ 1/f dynamics are linked to cardiac activity

Revue : —

Code des auteurs : schmidtfa/cardiac_1_f (BSD-3-Clause), schmidtfa/ecg_1f_memory (BSD-3-Clause)

Statut : code vérifié, 62 fichiers lisibles

[188] doi:10.1002/hbm.70368 [article, code]

The Mismatch Negativity Compared: EEG, SQUID‐MEG, and Novel 4 Helium‐OPMs

Revue : —

Code des auteurs : tgutteling/opm_mmn (sans licence)

Statut : code vérifié, 17 fichiers lisibles

[189] doi:10.1007/s00429-025-03012-5 [article, code]

The neurophysiology of healthy and pathological aging: a comprehensive systematic review

Revue : —

Code des auteurs : gemmaferu/systematic-review-neurophysiology-aging (sans licence)

Statut : code vérifié, 2 fichiers lisibles

[190] doi:10.1162/imag.a.105 [article, code]

Right posterior theta reflects human parahippocampal phase resetting by salient cues during goal-directed navigation

Revue : —

Code des auteurs : bakerlabrutgers/phg_phase_resetting (sans licence)

Statut : code vérifié, 55 fichiers lisibles

[191] doi:10.1038/s41467-025-62798-4 [article, code]

Distinct manifestations of excitatory-inhibitory imbalance associated with amyloid-β and tau in patients with Alzheimer’s disease

Revue : —

Code des auteurs : kamalinigr/megabtaufdg (sans licence)

Statut : dépôt vide, 1 fichier lisibles

[192] doi:10.1038/s41467-025-63281-w [article, code]

Trait anxiety is associated with reduced reward-related replay at rest

Revue : —

Code des auteurs : Zenodo 15795242 (CC-BY-4.0)

Statut : code vérifié, 14 fichiers lisibles

[193] doi:10.1038/s41598-025-08037-8 [article, code]

OPM-MEG reveals dynamics of beta bursts underlying attentional processes in sensory cortex

Revue : —

Code des auteurs : gonreina/braille_paradigm (sans licence)

Statut : code vérifié, 6 fichiers lisibles

[194] doi:10.1038/s42003-025-08618-3 [article, code]

Physical activity simultaneously improves working memory and ripple-spindle coupling

Revue : —

Code des auteurs : sduerschmid/physicalexerciseworkingmemory (sans licence)

Statut : code vérifié, 51 fichiers lisibles

[195] doi:10.1162/netn_a_00453 [article, code]

Joint estimation of source dynamics and interactions from MEG data

Revue : —

Code des auteurs : narayanps/jedimeg (MIT)

Statut : code vérifié, 104 fichiers lisibles

[196] doi:10.1038/s41467-025-60860-9 [article, code]

Reply to: “Model mimicry limits conclusions about neural tuning and can mistakenly imply unlikely priors”

Revue : —

Code des auteurs : osf:65dca (sans licence)

Statut : code vérifié, 6 fichiers lisibles

[197] doi:10.1038/s41597-025-05174-7 [article, code]

A large-scale MEG and EEG dataset for object recognition in naturalistic scenes

Revue : —

Code des auteurs : bnucnl/naturalvisionproject (sans licence), colehank/nod-meeg (MIT)

Statut : code vérifié, 76 fichiers lisibles

[198] doi:10.1117/1.nph.12.2.025011 [article, code]

NIRSTORM: a Brainstorm extension dedicated to functional near-infrared spectroscopy data analysis, advanced 3D reconstructions, and optimal probe design

Revue : —

Code des auteurs : nirstorm/nirstorm (AGPL-3.0)

Statut : code vérifié, 153 fichiers lisibles

[199] doi:10.1093/braincomms/fcaf170 [article, code]

Noninvasive classification of physiological and pathological high frequency oscillations in children

Revue : —

Code des auteurs : lorenzofabbri95/noninvasive-classification-of-physiological-and-pathological-high-frequency-oscillations-in-children (sans licence)

Statut : code vérifié, 32 fichiers lisibles

[200] doi:10.1371/journal.pcbi.1013007 [article, code]

Traveling waves in the human visual cortex: An MEG-EEG model-based approach

Revue : —

Code des auteurs : Zenodo 13968952 (CC-BY-4.0), laetitiag/wavesmodel (sans licence)

Statut : code vérifié, 22 fichiers lisibles