Tail-aware heterogeneous graph neural networks for multi-class drug-drug interaction prediction.
Revue : Bioinformatics (Oxford, England)
Parution : Samedi 1 août 2026
Statut : code vérifié
Méthodes : Connectivité, Apprentissage
Carte de traçage
Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.
Code des auteurs
varshagnanasekar/ddi_prediction
Licence : aucune : les auteurs gardent tous leurs droits
État : le lien répond
Preuve : fichiers inventoriés
Commit :
c29f9dc72556dc488510c3d4b49d73ce5f7d746eLangages : Python (24)
Trouvé : « Data availability »
24 fichiers, à lire à la source
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- 1_preprocessing/1_drug_smiles.py — Python, 263 lignes
- 1_preprocessing/2_ddi_edges.py — Python, 509 lignes
- 1_preprocessing/3_protein_nodes.py — Python, 175 lignes
- 1_preprocessing/4_ppi_edges.py — Python, 237 lignes
- 1_preprocessing/5_auxiliary_nodes.py — Python, 334 lignes
- 1_preprocessing/6_drug_features.py — Python, 100 lignes
- 1_preprocessing/7_protein_features.py — Python, 169 lignes
- 1_preprocessing/8_graph_builder.py — Python, 310 lignes
- 2_baseline/models/__init__.py — Python, 1 ligne
- 2_baseline/models/gcn.py — Python, 164 lignes
- 2_baseline/models/hgt.py — Python, 163 lignes
- 2_baseline/models/hybrid.py — Python, 238 lignes
- 2_baseline/models/rgcn.py — Python, 174 lignes
- 2_baseline/run_baselines.py — Python, 383 lignes
- 2_baseline/utils/__init__.py — Python, 1 ligne
- 2_baseline/utils/config.py — Python, 144 lignes
- 2_baseline/utils/losses.py — Python, 61 lignes
- 2_baseline/utils/memory.py — Python, 41 lignes
- 2_baseline/utils/training.py — Python, 627 lignes
- 3_hyperparameter_tuning/rgcn_tuning.py — Python, 637 lignes
- 3_hyperparameter_tuning/run_tuning.py — Python, 399 lignes
- 4_loss_experiments/losses.py — Python, 96 lignes
- 4_loss_experiments/rgcn_loss.py — Python, 723 lignes
- 4_loss_experiments/run_loss_experiment.py — Python, 342 lignes