Unified representation learning for spatial multi-omics.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Parution : Samedi 1 août 2026

Statut : code vérifié

Méthodes : Lissage, filtrage d'état, décompositions, Apprentissage, Prétraitement, Connectivité

Carte de traçage

Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.

Code des auteurs

vitaintelli-cqu/spaalign

Licence : aucune : les auteurs gardent tous leurs droits

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Commit : f7a41b723c421624e3e9987fc85f6d338844c82f

Langages : Python (10), Jupyter (4)

Trouvé : « Code availability »

15 fichiers, à lire à la source

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SpaAlign/__init__.py — Python, 2 lignes
SpaAlign/contrastive_loss.py — Python, 84 lignes
SpaAlign/hipt_4k.py — Python, 106 lignes
SpaAlign/hipt_model_utils.py — Python, 69 lignes
SpaAlign/hist_features.py — Python, 503 lignes
SpaAlign/model.py — Python, 259 lignes
SpaAlign/nets.py — Python, 119 lignes
SpaAlign/utils.py — Python, 187 lignes
SpaAlign/vision_transformer.py — Python, 330 lignes
SpaAlign/vision_transformer4k.py — Python, 268 lignes
tutorial/Tutorial1_simulation.ipynb — Jupyter, 94 lignes
tutorial/Tutorial2_HLN.ipynb — Jupyter, 86 lignes
tutorial/Tutorial3_Mouse_brain.ipynb — Jupyter, 102 lignes
tutorial/Tutorial4_Tonsil.ipynb — Jupyter, 130 lignes
README.md — Texte, 79 lignes

Zenodo 20250508

Licence : CC-BY-4.0

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Trouvé : « Code availability »

15 fichiers

SpaAlign/__init__.py — Python, 2 lignes [lire ici]
SpaAlign/contrastive_loss.py — Python, 84 lignes [lire ici]
SpaAlign/hipt_4k.py — Python, 106 lignes [lire ici]
SpaAlign/hipt_model_utils.py — Python, 69 lignes [lire ici]
SpaAlign/hist_features.py — Python, 503 lignes [lire ici]
SpaAlign/model.py — Python, 259 lignes [lire ici]
SpaAlign/nets.py — Python, 119 lignes [lire ici]
SpaAlign/utils.py — Python, 187 lignes [lire ici]
SpaAlign/vision_transformer.py — Python, 330 lignes [lire ici]
SpaAlign/vision_transformer4k.py — Python, 268 lignes [lire ici]
tutorial/Tutorial1_simulation.ipynb — Jupyter, 94 lignes [lire ici]
tutorial/Tutorial2_HLN.ipynb — Jupyter, 86 lignes [lire ici]
tutorial/Tutorial3_Mouse_brain.ipynb — Jupyter, 102 lignes [lire ici]
tutorial/Tutorial4_Tonsil.ipynb — Jupyter, 130 lignes [lire ici]
README.md — Texte, 62 lignes [lire ici]