Connectome Gradient-Based Subtyping of Major Depressive Disorder Reveals Distinct Neurobiological and Transcriptomic Signatures.
Revue : Depression and anxiety
Parution : Mercredi 2 septembre 2026
DOI : 10.1155/da/8792696
Statut : code vérifié
Méthodes : Connectivité, Statistiques, Apprentissage, IRMf et imagerie
Carte de traçage
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Code des auteurs
evarol/hydra
Licence : autre
État : le lien répond
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Commit :
25c15b2c37cc78105be4afc171f3a75338338057Langages : MATLAB (2)
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- hydra.m — MATLAB, 635 lignes
- hydra_solver.m — MATLAB, 711 lignes
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- README.txt — Texte, 143 lignes
mica-mni/brainspace
Licence : BSD-3-Clause
État : le lien répond
Preuve : fichiers inventoriés
Commit :
8730de88ae32c4f88eeaf16ef2a6e53c5c32dc34Langages : Python (77), MATLAB (40), Jupyter (4)
Trouvé : « Data Availability Statement »
123 fichiers
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- brainspace/datasets/__init__.py — Python, 15 lignes [lire ici]
- brainspace/datasets/base.py — Python, 322 lignes [lire ici]
- brainspace/examples/__init__.py — Python, 1 ligne
- brainspace/examples/plot_tutorial0.py — Python, 182 lignes [lire ici]
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- brainspace/gradient/kernels.py — Python, 98 lignes [lire ici]
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- brainspace/mesh/__init__.py — Python, 10 lignes [lire ici]
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- brainspace/mesh/mesh_cluster.py — Python, 252 lignes [lire ici]
- brainspace/mesh/mesh_correspondence.py — Python, 94 lignes [lire ici]
- brainspace/mesh/mesh_creation.py — Python, 110 lignes [lire ici]
- brainspace/mesh/mesh_elements.py — Python, 766 lignes [lire ici]
- brainspace/mesh/mesh_io.py — Python, 211 lignes [lire ici]
- brainspace/mesh/mesh_operations.py — Python, 587 lignes [lire ici]
- brainspace/null_models/__init__.py — Python, 12 lignes [lire ici]
- brainspace/null_models/moran.py — Python, 308 lignes [lire ici]
- brainspace/null_models/spin.py — Python, 347 lignes [lire ici]
- brainspace/null_models/variogram.py — Python, 2 005 lignes [lire ici]
- brainspace/plotting/__init__.py — Python, 6 lignes [lire ici]
- brainspace/plotting/base.py — Python, 501 lignes [lire ici]
- brainspace/plotting/colormaps.py — Python, 87 lignes [lire ici]
- brainspace/plotting/defaults_plotting.py — Python, 55 lignes [lire ici]
- brainspace/plotting/sphinx_gallery_scrapper.py — Python, 45 lignes [lire ici]
- brainspace/plotting/surface_plotting.py — Python, 633 lignes [lire ici]
- brainspace/plotting/utils.py — Python, 400 lignes [lire ici]
- brainspace/plotting/utils_qt.py — Python, 19 lignes [lire ici]
- brainspace/tests/__init__.py — Python, 1 ligne
- brainspace/tests/test_aligned_lambdas.py — Python, 93 lignes [lire ici]
- brainspace/tests/test_alignment_methods.py — Python, 64 lignes [lire ici]
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- brainspace/tests/test_gradient_path_inputs.py — Python, 133 lignes [lire ici]
- brainspace/tests/test_issue_133.py — Python, 37 lignes [lire ici]
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- brainspace/tests/test_parcellation.py — Python, 313 lignes [lire ici]
- brainspace/tests/test_plotting.py — Python, 274 lignes [lire ici]
- brainspace/tests/test_vtk94_compatibility.py — Python, 208 lignes [lire ici]
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- brainspace/utils/__init__.py — Python, 3 lignes [lire ici]
- brainspace/utils/parcellation.py — Python, 369 lignes [lire ici]
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- brainspace/vtk_interface/decorators.py — Python, 300 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/io_support/__init__.py — Python, 8 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/io_support/freesurfer_support.py — Python, 254 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/io_support/gifti_support.py — Python, 159 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/pipeline.py — Python, 352 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/wrappers/__init__.py — Python, 78 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/wrappers/actor.py — Python, 328 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/wrappers/algorithm.py — Python, 327 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/wrappers/base.py — Python, 732 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/wrappers/data_object.py — Python, 561 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/wrappers/lookup_table.py — Python, 80 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/wrappers/misc.py — Python, 111 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/wrappers/property.py — Python, 30 lignes [lire ici]
- brainspace/vtk_interface/wrappers/renderer.py — Python, 250 lignes [lire ici]
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- docs/conf.py — Python, 249 lignes [lire ici]
- docs/python_doc/auto_examples/plot_tutorial0.ipynb — Jupyter, 187 lignes [lire ici]
- docs/python_doc/auto_examples/plot_tutorial0.py — Python, 182 lignes [lire ici]
- docs/python_doc/auto_examples/plot_tutorial1.ipynb — Jupyter, 92 lignes [lire ici]
- docs/python_doc/auto_examples/plot_tutorial1.py — Python, 84 lignes [lire ici]
- docs/python_doc/auto_examples/plot_tutorial2.ipynb — Jupyter, 272 lignes [lire ici]
- docs/python_doc/auto_examples/plot_tutorial2.py — Python, 253 lignes [lire ici]
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- matlab/@GradientMaps/fit.m — MATLAB, 142 lignes [lire ici]
- matlab/analysis_code/@variogram/variogram.m — MATLAB, 339 lignes [lire ici]
- matlab/analysis_code/compute_mem.m — MATLAB, 141 lignes [lire ici]
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- matlab/analysis_code/spin_permutations.m — MATLAB, 105 lignes [lire ici]
- matlab/example_data_loaders/load_conte69.m — MATLAB, 30 lignes [lire ici]
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- matlab/plot_data/@plot_hemispheres/plot_hemispheres.m — MATLAB, 177 lignes [lire ici]
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- matlab/plot_data/@plot_hemispheres/private/process_views.m — MATLAB, 50 lignes [lire ici]
- matlab/plot_data/gradient_in_euclidean.m — MATLAB, 108 lignes [lire ici]
- matlab/plot_data/scree_plot.m — MATLAB, 18 lignes [lire ici]
- matlab/surface_manipulation/SurfStatReadSurf1.m — MATLAB, 164 lignes [lire ici]
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- matlab/tests/@datasets_tests/datasets_tests.m — MATLAB, 83 lignes [lire ici]
- matlab/tests/@diffusion_mapping_tests/diffusion_mapping_tests.m — MATLAB, 57 lignes [lire ici]
- matlab/tests/@utils_tests/utils_tests.m — MATLAB, 34 lignes [lire ici]
- setup.py — Python, 86 lignes [lire ici]
- LICENSE — Licence, 29 lignes [lire ici]
- README.rst — Texte, 43 lignes [lire ici]
jfortin1/combatharmonization
Licence : aucune : les auteurs gardent tous leurs droits
État : le lien répond
Preuve : fichiers inventoriés
Commit :
91f8bf3045381776c79358d2772e6ace135e21ceLangages : MATLAB (8), R (6), Python (2)
Trouvé : « Data Availability Statement »
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- Matlab/scripts/aprior.m — MATLAB, 5 lignes
- Matlab/scripts/bprior.m — MATLAB, 5 lignes
- Matlab/scripts/combat.m — MATLAB, 127 lignes
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- Matlab/scripts/itSol.m — MATLAB, 18 lignes
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- Testing/compare.R — R, 45 lignes
- Testing/compareToSva.R — R, 75 lignes
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- Testing/norm_python_training.py — Python, 51 lignes
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- Testing/norm_r_training.R — R, 56 lignes
- README.md — Texte, 119 lignes