Cellular transcriptomic signatures underpinning the heterogeneity of depression in Alzheimer's disease.

Revue : Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association

Parution : Mardi 1 septembre 2026

Statut : code vérifié

Méthodes : Statistiques

Carte de traçage

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Code des auteurs

nctrailrunner/nps_manuscript

Licence : aucune : les auteurs gardent tous leurs droits

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Commit : 470c908d9fe0002040dceaed395d859486e283a3

Langages : R (21), Shell (1)

Trouvé : « DATE AVAILABILITY STATEMENT »

23 fichiers, à lire à la source

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1.create_subsamples.sh — Shell, 72 lignes
11.cell_type_DE_analysis.R — R, 272 lignes
12.AD.DEP.cell_type_DE_analysis_adjusted.R — R, 493 lignes
13.Normal.DEP.cell_type_DE_analysis.R — R, 285 lignes
14.AD.DEP.cell_type_subset_FDR.R — R, 180 lignes
14.Normal.DEP.cell_type_subset_FDR.R — R, 180 lignes
15.AD_DEP_vs_MDD.new.intersection.mayo.R — R, 380 lignes
15.AD_DEP_vs_Normal_DEP.intersection.mayo.R — R, 380 lignes
16.cellchat.AD.DEP.R — R, 367 lignes
17.cellchat.Normal.DEP.R — R, 361 lignes
3.annotate_cells.R — R, 74 lignes
4.merge_annotations.R — R, 22 lignes
5.sct_normalization.R — R, 36 lignes
6.integrate_datasets.R — R, 102 lignes
7.RNA_cluster.R — R, 90 lignes
7.final_cluster.R — R, 163 lignes
8.scmayomap.R — R, 201 lignes
9.merge_objects.R — R, 69 lignes
cellchat.MDD.Normal.R — R, 312 lignes
h5ad_to_seurat.R — R, 176 lignes
process_single_sample.R — R, 250 lignes
seurat_to_h5ad.R — R, 99 lignes
README.md — Texte, 105 lignes