SlotDeconv: spatial transcriptomics deconvolution via diversity-constrained prototype learning and spatial refinement.

Revue : Bioinformatics (Oxford, England)

Parution : Samedi 1 août 2026

Statut : code vérifié

Méthodes : Statistiques, Prétraitement, Connectivité, IRMf et imagerie, Apprentissage

Carte de traçage

Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.

Code des auteurs

hannahnjit/slotdeconv

Licence : MIT

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Commit : 5819b15a6acc9e753a16c1c781ca0b155edfc7fa

Langages : Python (5), Jupyter (1)

Trouvé : « Data availability »

8 fichiers

model/plot.py — Python, 220 lignes [lire ici]
model/run_slot.py — Python, 94 lignes [lire ici]
model/slot_model.py — Python, 477 lignes [lire ici]
model/slot_utility.py — Python, 234 lignes [lire ici]
model/visz.py — Python, 783 lignes [lire ici]
tutorial.ipynb — Jupyter, 148 lignes [lire ici]
LICENSE — Licence, 21 lignes [lire ici]
README.md — Texte, 132 lignes [lire ici]