PMPIHGLL: predicting metabolite-protein interactions using dual hypergraph convolutional networks and large language models.

Revue : Briefings in bioinformatics

Parution : Mardi 1 septembre 2026

Statut : code vérifié

Méthodes : Apprentissage, Statistiques

Carte de traçage

Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.

Code des auteurs

ztjin958/pmpihgll

Licence : aucune : les auteurs gardent tous leurs droits

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Commit : 9c5d5df6dafead48a4a841deb5b1f51ec7101bb3

Langages : Python (29)

Trouvé : le texte, « Conclusion »

30 fichiers, à lire à la source

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Model.py — Python, 186 lignes
Prepare.py — Python, 177 lignes
_count_test_piazza_pmidb.py — Python, 127 lignes
datasets_processed.py — Python, 73 lignes
export_local_protein_folds_for_enzpred.py — Python, 172 lignes
generate_local_cv_scripts.py — Python, 85 lignes
main.py — Python, 165 lignes
main_local_cv.py — Python, 415 lignes
main_local_piazza_meta.py — Python, 16 lignes
main_local_piazza_protein.py — Python, 16 lignes
main_local_pmidb_human_meta.py — Python, 16 lignes
main_local_pmidb_human_protein.py — Python, 16 lignes
main_local_stitch_ecoli_400_meta.py — Python, 16 lignes
main_local_stitch_ecoli_400_protein.py — Python, 16 lignes
main_local_stitch_ecoli_700_meta.py — Python, 16 lignes
main_local_stitch_ecoli_700_protein.py — Python, 16 lignes
main_local_stitch_yeast_400_meta.py — Python, 16 lignes
main_local_stitch_yeast_400_protein.py — Python, 16 lignes
main_local_stitch_yeast_700_meta.py — Python, 16 lignes
main_local_stitch_yeast_700_protein.py — Python, 16 lignes
main_stitch_train_piazza_test.py — Python, 344 lignes
merge_piazza_pmidb_ecoil.py — Python, 539 lignes
piazza/_check_overlap.py — Python, 68 lignes
piazza/filter_piazza_vs_stitch.py — Python, 102 lignes
plot_meta_hypergraph_by_source.py — Python, 941 lignes
prepare_core.py — Python, 370 lignes
prepare_transductive_stitch_piazza.py — Python, 553 lignes
sweep_drop_test_only_proteins.py — Python, 190 lignes
utils.py — Python, 468 lignes
README.md — Texte, 152 lignes