RNA splicing and cardiovascular disease: a guide for cardiologists.

Revue : European heart journal

Parution : Mardi 1 septembre 2026

Statut : code vérifié

Méthodes : Spectre et temps-fréquence, Apprentissage

Carte de traçage

Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.

Code des auteurs

gaolabtools/heart-isoform-atlas

Licence : autre

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Commit : c31daf39a3996edb6cee8074cec9df54a194d613

Langages : R (18), Shell (5), Python (1)

Trouvé : le tableau des ressources

25 fichiers, à lire à la source

La licence de ce dépôt ne permet pas d'en republier le texte : lisez-le à la source.

scripts/gene_expression/calculate_GSEA.R — R, 61 lignes
scripts/gene_expression/calculate_cell-cell-interactions.py — Python, 27 lignes
scripts/gene_expression/calculate_correlation.R — R, 24 lignes
scripts/gene_expression/calculate_degs.R — R, 26 lignes
scripts/gene_expression/calculate_gene-ontology-ORA.R — R, 39 lignes
scripts/gene_expression/plot_Heatmap.R — R, 67 lignes
scripts/gene_expression/plot_UMAP.R — R, 35 lignes
scripts/gene_expression/plot_Volcano.R — R, 37 lignes
scripts/gene_expression/processing_harmony-integration.R — R, 57 lignes
scripts/gene_expression/processing_sample-seurat-objects.R — R, 37 lignes
scripts/gene_expression/processing_subclustering.R — R, 31 lignes
scripts/isoform/calculate_DEIs.R — R, 12 lignes
scripts/isoform/calculate_DIU.R — R, 77 lignes
scripts/isoform/calculate_diversity.R — R, 8 lignes
scripts/isoform/diversity-vs-proportion.R — R, 55 lignes
scripts/isoform/isoform-clustering.R — R, 24 lignes
scripts/isoform/isoforms-qc.R — R, 93 lignes
scripts/isoform/plot_gene-expr-and-isoform-proportions.R — R, 116 lignes
scripts/isoform/plot_transcript-track.R — R, 44 lignes
scripts/isoform/run_ggsashimi.sh — Shell, 35 lignes
scripts/isoform/run_isoquant.sh — Shell, 15 lignes
scripts/isoform/run_sqanti.sh — Shell, 11 lignes
scripts/isoform/run_suppa.sh — Shell, 11 lignes
scripts/scNanoGPS/run_scNanoGPS.sh — Shell, 27 lignes
README.md — Texte, 8 lignes

laptopbiologist/katmap

Licence : Apache-2.0

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Commit : a8507c22628a4d67a2d4656ab826c63960c448b7

Langages : Python (30), Jupyter (19), JavaScript (6)

Trouvé : le tableau des ressources

57 fichiers

00_Example_ConstructingRNAmaps.ipynb — Jupyter, 506 lignes [lire ici]
01_rnamap.ipynb — Jupyter, 1 348 lignes [lire ici]
02_parsers.ipynb — Jupyter, 1 175 lignes [lire ici]
02a_parsers_dataset.ipynb — Jupyter, 129 lignes [lire ici]
05_coverage.ipynb — Jupyter, 59 lignes [lire ici]
06a_seq_summaries.ipynb — Jupyter, 1 257 lignes [lire ici]
06b_seq_summaries_experimental.ipynb — Jupyter, 399 lignes [lire ici]
30_stats_binding.ipynb — Jupyter, 492 lignes [lire ici]
41_experimental_INLA.ipynb — Jupyter, 4 085 lignes [lire ici]
43_experimental_diagnostics.ipynb — Jupyter, 761 lignes [lire ici]
44_inference_summaries.ipynb — Jupyter, 254 lignes [lire ici]
45_models_lm.ipynb — Jupyter, 696 lignes [lire ici]
46_model_formulas.ipynb — Jupyter, 225 lignes [lire ici]
51_plotting.ipynb — Jupyter, 458 lignes [lire ici]
53_mikemaps.ipynb — Jupyter, 3 824 lignes [lire ici]
60_CommandLineParsers.ipynb — Jupyter, 294 lignes [lire ici]
70_bamfiles_converters.ipynb — Jupyter, 623 lignes [lire ici]
90_utilities.ipynb — Jupyter, 114 lignes [lire ici]
docs/js/customscripts.js — JavaScript, 54 lignes [lire ici]
docs/js/jekyll-search.js — JavaScript, 1 ligne [lire ici]
docs/js/jquery.ba-throttle-debounce.min.js — JavaScript, 9 lignes [lire ici]
docs/js/jquery.navgoco.min.js — JavaScript, 8 lignes [lire ici]
docs/js/jquery.shuffle.min.js — JavaScript, 1 588 lignes [lire ici]
docs/js/toc.js — JavaScript, 90 lignes [lire ici]
index.ipynb — Jupyter, 1 546 lignes [lire ici]
katmap.py — Python, 70 lignes [lire ici]
katmap/__init__.py — Python, 1 ligne [lire ici]
katmap/_nbdev.py — Python, 235 lignes [lire ici]
katmap/bamfiles/__init__.py — Python, 1 ligne
katmap/bamfiles/converters.py — Python, 411 lignes [lire ici]
katmap/commandline.py — Python, 283 lignes [lire ici]
katmap/datasets.py — Python, 109 lignes [lire ici]
katmap/experimental/INLA.py — Python, 2 823 lignes [lire ici]
katmap/experimental/__init__.py — Python, 1 ligne
katmap/inference/__init__.py — Python, 1 ligne
katmap/inference/diagnostics.py — Python, 647 lignes [lire ici]
katmap/inference/summaries.py — Python, 184 lignes [lire ici]
katmap/mikesmaps.py — Python, 3 440 lignes [lire ici]
katmap/models/__init__.py — Python, 1 ligne
katmap/models/formulas.py — Python, 109 lignes [lire ici]
katmap/models/lm.py — Python, 696 lignes [lire ici]
katmap/parsers.py — Python, 777 lignes [lire ici]
katmap/plotting.py — Python, 342 lignes [lire ici]
katmap/rnamap.py — Python, 975 lignes [lire ici]
katmap/seq/__init__.py — Python, 1 ligne
katmap/seq/experimental.py — Python, 281 lignes [lire ici]
katmap/seq/summaries.py — Python, 960 lignes [lire ici]
katmap/stats/__init__.py — Python, 1 ligne
katmap/stats/binding.py — Python, 324 lignes [lire ici]
katmap/stats/coverage.py — Python, 30 lignes [lire ici]
katmap/utilities.py — Python, 92 lignes [lire ici]
makeconfig.py — Python, 42 lignes [lire ici]
precompute_impacts.py — Python, 170 lignes [lire ici]
setup.py — Python, 64 lignes [lire ici]
test_installation.py — Python, 90 lignes [lire ici]
LICENSE — Licence, 201 lignes [lire ici]
README.md — Texte, 6 916 lignes [lire ici]