NIRSTORM: a Brainstorm extension dedicated to functional near-infrared spectroscopy data analysis, advanced 3D reconstructions, and optimal probe design

Revue : —

Parution : Date inconnue

Statut : code vérifié

Méthodes : Spectre et temps-fréquence, Statistiques, Prétraitement, Potentiels évoqués, IRMf et imagerie

Carte de traçage

Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.

Code des auteurs

nirstorm/nirstorm

Licence : AGPL-3.0

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Commit : 1603dad92e93000172a2069b182ff8d7d0e7fa62

Langages : MATLAB (148), C/C++ (1), C (1), Python (1)

Trouvé : « Code and Data Availability »

153 fichiers

bst_plugin/GLM/nst_glm_add_regressors.m — MATLAB, 338 lignes [lire ici]
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bst_plugin/GLM/nst_make_event_toeplitz_mtx.m — MATLAB, 49 lignes [lire ici]
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bst_plugin/GLM/process_nst_glm_contrast.m — MATLAB, 226 lignes [lire ici]
bst_plugin/GLM/process_nst_glm_contrast_mask.m — MATLAB, 154 lignes [lire ici]
bst_plugin/GLM/process_nst_glm_contrast_ttest.m — MATLAB, 157 lignes [lire ici]
bst_plugin/GLM/process_nst_glm_fit.m — MATLAB, 707 lignes [lire ici]
bst_plugin/GLM/process_nst_glm_fit1.m — MATLAB, 59 lignes [lire ici]
bst_plugin/GLM/process_nst_glm_group_ttest.m — MATLAB, 272 lignes [lire ici]
bst_plugin/GLM/process_nst_mask_from_atlas.m — MATLAB, 144 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/panel_nst_OM.m — MATLAB, 753 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/panel_nst_rename_montage.m — MATLAB, 247 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/panel_nst_search_space.m — MATLAB, 223 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_OM.m — MATLAB, 1 323 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_compare_montage.m — MATLAB, 746 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_cpt_fluences_om.m — MATLAB, 44 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_export_channels_info.m — MATLAB, 335 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_extract_sensitivity_from_head_model_om.m — MATLAB, 43 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_import_head_model_om.m — MATLAB, 44 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_merge_metrics.m — MATLAB, 214 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_merge_montage.m — MATLAB, 200 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_rename_montage.m — MATLAB, 89 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_search_space.m — MATLAB, 128 lignes [lire ici]
bst_plugin/OM/process_nst_snap_montage.m — MATLAB, 97 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_bst_add_surf_data.m — MATLAB, 96 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_bst_set_template_anatomy.m — MATLAB, 45 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_core_get_available_templates.m — MATLAB, 6 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_format_channel.m — MATLAB, 40 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_get_bst_func_files.m — MATLAB, 63 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_get_pair_indexes_from_names.m — MATLAB, 47 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_get_version.m — MATLAB, 16 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_measure_types.m — MATLAB, 12 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_montage_info_from_bst_channels.m — MATLAB, 141 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_run_bst_proc.m — MATLAB, 355 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_unformat_channel.m — MATLAB, 53 lignes [lire ici]
bst_plugin/core/nst_unformat_channels.m — MATLAB, 118 lignes [lire ici]
bst_plugin/deprecated/process_nst_sci.m — MATLAB, 218 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/nst_get_hb_extinctions.m — MATLAB, 429 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/nst_get_tissues_optical_properties.m — MATLAB, 41 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/nst_headmodel_get_FOV.m — MATLAB, 25 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/nst_headmodel_get_gains.m — MATLAB, 20 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/panel_nst_fluences.m — MATLAB, 600 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/process_nst_compute_voronoi.m — MATLAB, 351 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/process_nst_cpt_cortex_to_head_distance.m — MATLAB, 121 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/process_nst_cpt_fluences.m — MATLAB, 586 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/process_nst_extract_sensitivity_from_head_model.m — MATLAB, 412 lignes [lire ici]
bst_plugin/forward/process_nst_import_head_model.m — MATLAB, 680 lignes [lire ici]
bst_plugin/inverse/process_nst_bootstrap_MEM.m — MATLAB, 114 lignes [lire ici]
bst_plugin/inverse/process_nst_bootstrap_MNE.m — MATLAB, 413 lignes [lire ici]
bst_plugin/inverse/process_nst_cmem.m — MATLAB, 327 lignes [lire ici]
bst_plugin/inverse/process_nst_wmne.m — MATLAB, 308 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_download.m — MATLAB, 23 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_filter_table.m — MATLAB, 167 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_format_pval.m — MATLAB, 13 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_get_formats.m — MATLAB, 6 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_get_local_user_dir.m — MATLAB, 3 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_get_repository_url.m — MATLAB, 3 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_io_fetch_sample_data.m — MATLAB, 78 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_parse_bst_item_name.m — MATLAB, 21 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_request_files.m — MATLAB, 234 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_save_figure.m — MATLAB, 19 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_save_table_in_bst.m — MATLAB, 67 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/nst_split_ftp.m — MATLAB, 12 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/process_nst_export_nirs.m — MATLAB, 154 lignes [lire ici]
bst_plugin/io/process_nst_project_volumes.m — MATLAB, 192 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/dg_chamfer.h — C/C++, 207 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/dg_voronoi.c — C, 325 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/dg_voronoi.m — MATLAB, 27 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_knnsearch.m — MATLAB, 117 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_math_WelfordVariance.m — MATLAB, 63 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_math_build_basis_dct.m — MATLAB, 100 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_math_dctmtx.m — MATLAB, 8 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_math_fit_AR.m — MATLAB, 12 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_mbll_source.m — MATLAB, 108 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_mne_lcurve.m — MATLAB, 121 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_mne_lcurve_MAP.m — MATLAB, 101 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_pdist.m — MATLAB, 13 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_spline_correction.m — MATLAB, 162 lignes [lire ici]
bst_plugin/math/nst_tddr_correction.m — MATLAB, 102 lignes [lire ici]
bst_plugin/mbll/process_nst_dOD.m — MATLAB, 266 lignes [lire ici]
bst_plugin/mbll/process_nst_mbll.m — MATLAB, 631 lignes [lire ici]
bst_plugin/mbll/process_nst_mbll_dOD.m — MATLAB, 201 lignes [lire ici]
bst_plugin/misc/nst_misc_FOV_to_cortex.m — MATLAB, 18 lignes [lire ici]
bst_plugin/misc/nst_misc_convert_to_mumol.m — MATLAB, 17 lignes [lire ici]
bst_plugin/misc/nst_misc_unpack_glm_result.m — MATLAB, 16 lignes [lire ici]
bst_plugin/misc/nst_protect_fn_str.m — MATLAB, 14 lignes [lire ici]
bst_plugin/ppl/nst_ppl_1st_level_channel_V1.m — MATLAB, 764 lignes [lire ici]
bst_plugin/ppl/nst_ppl_surface_V1.m — MATLAB, 944 lignes [lire ici]
bst_plugin/ppl/nst_ppl_surface_template_V1.m — MATLAB, 1 284 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_channel_cluter_auto.m — MATLAB, 231 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_deglitch.m — MATLAB, 121 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_detect_bad.m — MATLAB, 424 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_detrend.m — MATLAB, 129 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_extract_ssc.m — MATLAB, 128 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_iir_filter.m — MATLAB, 450 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_motion_correction.m — MATLAB, 200 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_quality_check.m — MATLAB, 440 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_remove_ssc.m — MATLAB, 165 lignes [lire ici]
bst_plugin/preprocessing/process_nst_separations.m — MATLAB, 146 lignes [lire ici]
scripts/anatomy_based_full_group_pipeline_V1.m — MATLAB, 128 lignes [lire ici]
scripts/deglitch_example.m — MATLAB, 52 lignes [lire ici]
scripts/generate_colormap_matlab.py — Python, 79 lignes [lire ici]
scripts/nst_tutorial_tapping.m — MATLAB, 144 lignes [lire ici]
scripts/process_memo.m — MATLAB, 52 lignes [lire ici]
scripts/source_space_full_group_pipeline_V1.m — MATLAB, 96 lignes [lire ici]
scripts/surface_group_pipeline_V1.m — MATLAB, 119 lignes [lire ici]
scripts/surface_template_full_group_pipeline_V1.m — MATLAB, 81 lignes [lire ici]
scripts/surface_template_full_group_pipeline_V1_all_opts.m — MATLAB, 118 lignes [lire ici]
scripts/tutorial_nirstorn_2024.m — MATLAB, 327 lignes [lire ici]
test/ArFitTest.m — MATLAB, 53 lignes [lire ici]
test/BstHelperTest.m — MATLAB, 468 lignes [lire ici]
test/CSVImportTest.m — MATLAB, 563 lignes [lire ici]
test/ConcatMatrixTest.m — MATLAB, 255 lignes [lire ici]
test/DeglitchTest.m — MATLAB, 86 lignes [lire ici]
test/EVTImportTest.m — MATLAB, 138 lignes [lire ici]
test/FilterTableTest.m — MATLAB, 209 lignes [lire ici]
test/GLMTest.m — MATLAB, 387 lignes [lire ici]
test/InstallSourceTest.m — MATLAB, 460 lignes [lire ici]
test/MbllTest.m — MATLAB, 134 lignes [lire ici]
test/MontageTest.m — MATLAB, 197 lignes [lire ici]
test/OptimalMontageTest.m — MATLAB, 138 lignes [lire ici]
test/PrefixMatrixTest.m — MATLAB, 50 lignes [lire ici]
test/ProjectionTest.m — MATLAB, 150 lignes [lire ici]
test/RemoteDataTest.m — MATLAB, 91 lignes [lire ici]
test/SciTest.m — MATLAB, 123 lignes [lire ici]
test/ScriptTest.m — MATLAB, 32 lignes [lire ici]
test/SeparationTest.m — MATLAB, 65 lignes [lire ici]
test/SpreeTest.m — MATLAB, 126 lignes [lire ici]
test/SurfTplPipelineTest.m — MATLAB, 310 lignes [lire ici]
test/WorkShopPerform2018Test.m — MATLAB, 68 lignes [lire ici]
test/all_close.m — MATLAB, 22 lignes [lire ici]
test/bst_create_nirs_data.m — MATLAB, 160 lignes [lire ici]
test/bst_create_scout.m — MATLAB, 49 lignes [lire ici]
test/bst_create_test_protocol.m — MATLAB, 21 lignes [lire ici]
test/bst_create_test_subject.m — MATLAB, 31 lignes [lire ici]
test/cpt_spherical_fluences.m — MATLAB, 80 lignes [lire ici]
test/forge_activity_test_data.m — MATLAB, 237 lignes [lire ici]
test/run_tests.m — MATLAB, 134 lignes [lire ici]
test/utest_bst_setup.m — MATLAB, 29 lignes [lire ici]
test/utest_clean_bst.m — MATLAB, 19 lignes [lire ici]
test/utest_get_test_bst_events.m — MATLAB, 32 lignes [lire ici]
test/utest_import_nirs_in_bst.m — MATLAB, 66 lignes [lire ici]
test/utest_request_data.m — MATLAB, 4 lignes [lire ici]
test/utest_reset_bst.m — MATLAB, 19 lignes [lire ici]
LICENSE — Licence, 674 lignes [lire ici]
README.md — Texte, 46 lignes [lire ici]