Genomic Signatures of Selection Are Enriched in Differentially Expressed Genes in Sticklebacks Adapting to Contrasting Environments.
Revue : Genome biology and evolution
Parution : Mardi 1 septembre 2026
DOI : 10.1093/gbe/evag222
Statut : code vérifié
Méthodes : Lissage, filtrage d'état, décompositions, Statistiques
Carte de traçage
Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.
Code des auteurs
z0on/tag-based_rnaseq
Licence : aucune : les auteurs gardent tous leurs droits
État : le lien répond
Preuve : fichiers inventoriés
Commit :
0c8a25f81e7c0d35ef9c527d1f5a060db9c96b1fLangages : Perl (20), R (6), Python (3)
Trouvé : le texte, « Bioinformatic Processing »
30 fichiers, à lire à la source
Ce dépôt n'a pas de licence : ses auteurs gardent tous leurs droits. Lisez-le à la source.
- 2bRAD_bowtie2_launch.pl — Perl, 36 lignes
- countreads.pl — Perl, 21 lignes
- dna.mixing.R — R, 49 lignes
- dupCount.R — R, 27 lignes
- expression_compiler.pl — Perl, 47 lignes
- heatmapEveryWhichWay.R — R, 132 lignes
- iRNAseq_shrimpmap_SAM.pl — Perl, 42 lignes
- iRNAseq_trim_launch0.pl — Perl, 34 lignes
- isogroup_namer.pl — Perl, 67 lignes
- launcher_creator.py — Python, 536 lignes
- ls5_launcher_creator.py — Python, 460 lignes
- mix_illumina_qpcr.R — R, 66 lignes
- ngs_concat.pl — Perl, 41 lignes
- picogreen.R — R, 30 lignes
- rnaseq_clipper0.pl — Perl, 60 lignes
- rnaseq_clipper_fasta.pl — Perl, 50 lignes
- rnaseq_clipper_old.pl — Perl, 59 lignes
- samcount.pl — Perl, 134 lignes
- samcount_launch.pl — Perl, 34 lignes
- samcount_launch_bt2.pl — Perl, 25 lignes
- samcount_v.0.1.pl — Perl, 143 lignes
- selectFastaByHeader.pl — Perl, 38 lignes
- splitFastaByHeader.pl — Perl, 48 lignes
- tagseq_bowtie2map.pl — Perl, 42 lignes
- tagseq_clipper.pl — Perl, 96 lignes
- tagseq_trim_launch.pl — Perl, 42 lignes
- tagseq_trim_launch_bgi.pl — Perl, 31 lignes
- thetaByContig.py — Python, 148 lignes
- uniHeatmap.R — R, 89 lignes
- README.md — Texte, 24 lignes