Modeling synaptic interactions between mammalian breathing and swallowing central pattern generators.
Revue : Biological cybernetics
Parution : Vendredi 18 septembre 2026
Statut : code vérifié
Méthodes : Spectre et temps-fréquence, Connectivité, Prétraitement, Statistiques, Activité unitaire, imagerie calcique, Apprentissage
Carte de traçage
Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.
Code des auteurs
ptolmachev/simplifiedmodel_rcpg_swcpg_interaction
Licence : MIT
État : le lien répond
Preuve : fichiers inventoriés
Commit :
a6c77427e6f0466ce91650a5e99c8c287e6d9674Langages : Python (43)
Trouvé : « Code Availability »
45 fichiers
- code/rCPGswCPG/Experiment.py — Python, 238 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/Network.py — Python, 254 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/__init__.py — Python, 1 ligne
- code/rCPGswCPG/construct_protocol.py — Python, 14 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/experiments/KF_lesioning_different_amps.py — Python, 45 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/experiments/__init__.py — Python, 1 ligne
- code/rCPGswCPG/experiments/lesioning_KF.py — Python, 44 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/experiments/prc_running_simulations.py — Python, 155 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/experiments/tau_v_sweep.py — Python, 71 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/experiments/variation_single_param.py — Python, 81 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/experiments/varying_arousal_drive.py — Python, 39 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/model_params/__init__.py — Python, 1 ligne
- code/rCPGswCPG/model_params/config_loader.py — Python, 154 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/parameter_extraction/__init__.py — Python, 1 ligne
- code/rCPGswCPG/parameter_extraction/param_extraction_utils.py — Python, 205 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig4_exp_vs_sim_swallowing_and_breathing.py — Python, 98 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig5_PRC_comparison.py — Python, 146 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig6_Solitary_swallow_PIR/PIR_mechanism_solitary_swallow.py — Python, 39 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig6_Solitary_swallow_PIR/PIR_solitary_swallow_phase_space_analysis.py — Python, 210 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig6_Solitary_swallow_PIR/__init__.py — Python, 1 ligne
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig6_Solitary_swallow_PIR/isolating_drives_to_SwHCO.py — Python, 66 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig7_apn_vs_eupn.py — Python, 74 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig8_pathological_behavior.py — Python, 69 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig9_VNA_responses.py — Python, 69 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/Fig9_effect_of_varying_the_variables.py — Python, 193 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/__init__.py — Python, 1 ligne
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/plotting_PNA_VNA_Intact_different_amps.py — Python, 50 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/plotting_PNA_VNA_KF_inh_different_amps.py — Python, 50 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/plotting_effect_of_varying_arousal_drive.py — Python, 73 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/plotting_figures/plotting_utils.py — Python, 126 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/prc_extraction/__init__.py — Python, 1 ligne
- code/rCPGswCPG/prc_extraction/prc_extraction_subroutines/filtering_utils.py — Python, 64 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/prc_extraction/prc_extraction_subroutines/phase_extraction.py — Python, 112 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/prc_extraction/prc_extraction_subroutines/prc_extraction_linear_fit.py — Python, 66 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/prc_extraction/run_prc_extraction.py — Python, 85 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/protocols/__init__.py — Python, 1 ligne [lire ici]
- code/rCPGswCPG/protocols/protocols.py — Python, 136 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/run_model.py — Python, 71 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/utils/__init__.py — Python, 1 ligne [lire ici]
- code/rCPGswCPG/utils/gen_utils.py — Python, 45 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/utils/sp_utils.py — Python, 146 lignes [lire ici]
- code/rCPGswCPG/utils/utils.py — Python, 86 lignes [lire ici]
- code/setup.py — Python, 24 lignes [lire ici]
- LICENSE — Licence, 21 lignes [lire ici]
- README.md — Texte, 38 lignes [lire ici]