De novo structural variants in autism spectrum disorder disrupt distal regulatory interactions of neuronal genes.

Revue : Genome research

Parution : Mardi 1 septembre 2026

Statut : code vérifié

Méthodes : Statistiques, Connectivité, IRMf et imagerie, Spectre et temps-fréquence

Carte de traçage

Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.

Code des auteurs

ketringjoni/supremo

Licence : aucune : les auteurs gardent tous leurs droits

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Commit : 9799281ec9b4ea5ea03702931e57950903f75424

Langages : Python (10), Jupyter (5)

Trouvé : « Code availability »

16 fichiers, à lire à la source

Ce dépôt n'a pas de licence : ses auteurs gardent tous leurs droits. Lisez-le à la source.

scripts/SuPreMo.py — Python, 876 lignes
scripts/get_Akita_scores_utils.py — Python, 718 lignes
scripts/get_roi_utils.py — Python, 222 lignes
scripts/get_seq_utils.py — Python, 1 033 lignes
scripts/hicrep.py — Python, 84 lignes
scripts/plotting_utils.py — Python, 691 lignes
scripts/reading_utils.py — Python, 184 lignes
scripts/scoring.py — Python, 746 lignes
scripts/test_install_SuPreMo-Akita.py — Python, 41 lignes
scripts/test_install_SuPreMo.py — Python, 16 lignes
walkthroughs/SuPreMo-Akita_walkthrough.ipynb — Jupyter, 343 lignes
walkthroughs/SuPreMo-Akita_weighted_scores.ipynb — Jupyter, 354 lignes
walkthroughs/SuPreMo_walkthrough.ipynb — Jupyter, 358 lignes
walkthroughs/custom_perturbations.ipynb — Jupyter, 231 lignes
walkthroughs/example_application.ipynb — Jupyter, 396 lignes
README.md — Texte, 290 lignes