A unified framework for potency-oriented AMP discovery via multi-modal learning and guided sequence synthesis.

Revue : PLoS computational biology

Parution : Jeudi 3 septembre 2026

Statut : code vérifié

Méthodes : Connectivité, Apprentissage

Carte de traçage

Proposée automatiquement : ces liens ont été trouvés dans l'article et vérifiés à la source, sans relecture humaine. Elle recevra un DOI Zenodo quand un de ses auteurs l'aura validée avec son ORCID.

Code des auteurs

zhangwy49/multi-task-amp-discriminator-based-on-multi-scale-feature-fusion-and-amp-generator-guided-by-mic

Licence : Apache-2.0

État : le lien répond

Preuve : fichiers inventoriés

Commit : 1c9879d4ed6b1455a8bb01a2c931f581c89354ad

Langages : Python (31)

Trouvé : « Data Availability »

33 fichiers

AMP-Forge/scripts/configs/rnn_template.py — Python, 80 lignes [lire ici]
AMP-Forge/scripts/generate.py — Python, 392 lignes [lire ici]
AMP-Forge/scripts/train.py — Python, 123 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/__init__.py — Python, 1 ligne
AMP-Forge/src/common/constants.py — Python, 63 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/common/utils.py — Python, 98 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/dataio/__init__.py — Python, 1 ligne
AMP-Forge/src/dataio/proteins.py — Python, 94 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/__init__.py — Python, 5 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/base.py — Python, 321 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/modules/__init__.py — Python, 17 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/modules/components.py — Python, 308 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/modules/controller.py — Python, 66 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/modules/decoder.py — Python, 162 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/modules/encoder.py — Python, 77 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/modules/predictor.py — Python, 18 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/train_helper.py — Python, 19 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/vae.py — Python, 422 lignes [lire ici]
AMP-Forge/src/models/vae_module.py — Python, 131 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/config.py — Python, 16 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/datasets.py — Python, 79 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/get_embedding/discriminate.py — Python, 221 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/get_embedding/get_CNN_embedding.py — Python, 146 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/get_embedding/get_NCGCN_embedding.py — Python, 307 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/get_embedding/oracle.py — Python, 118 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/get_embedding/otherModels5_2Output.py — Python, 55 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/get_embedding/otherModelsRegression.py — Python, 62 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/graph_process/calculate_similarity_matrix.py — Python, 170 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/graph_process/get_feature_pretrain.py — Python, 99 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/models/NCGCN.py — Python, 130 lignes [lire ici]
AMP-Hunter/models/__init__.py — Python, 1 ligne [lire ici]
LICENSE — Licence, 201 lignes [lire ici]
README.md — Texte, 93 lignes [lire ici]